【问题标题】:How do I interpret `NA` coefficients from a GLM fit with the quasipoisson family?如何解释与准泊松家族拟合的 GLM 中的“NA”系数?
【发布时间】:2021-10-24 21:37:52
【问题描述】:

我正在使用 quasipoisson 系列在 R 中拟合模型,如下所示:

model <- glm(y ~ 0 + log_a + log_b + log_c + log_d + log_gm_a + 
   log_gm_b + log_gm_c + log_gm_d, family = quasipoisson(link = 'log'))

glm 查找前五个系数的值。它说其他人是NA。有趣的是,如果我对公式中的变量重新排序,glm 总是会找到公式中最先出现的五个变量的系数。

有足够的数据(行数是参数数的很多倍)。

我应该如何解释那些NA 系数?

我正在实施的模型的作者坚持认为NAs 暗示找到的系数为 0,但 NA 系数变量仍充当模型的控制。我怀疑发生了其他事情。

【问题讨论】:

    标签: r regression linear-regression glm


    【解决方案1】:

    我的猜测是作者(他说“NA 暗示找到的系数为 0,但 NA 系数变量仍充当模型的控制”)是错误的(尽管很难 100% 确定没有完整的上下文)。

    问题几乎可以肯定是您有一些多重共线性预测变量。不同变量被丢弃/返回NA 系数的原因是 R 部分使用顺序来确定要丢弃哪些变量(就拟合模型结果而言,这无关紧要 - 所有顶级结果(预测、拟合优度等)是相同的)。

    在 cmets 中,OP 说:

    log_alog_gm_a 之间的关系是,这是一个乘法固定效应模型。所以log_a 是预测器a 的日志。 log_gm_aa 的几何平均值的对数。因此,每个log_gm 项在所有观察中都是恒定的。

    这是诊断问题所需的关键信息。因为这个模型中排除了截距(公式包含0+,在模型矩阵中有一个常量列是可以的,但是多个常量列是麻烦的;除了第一个(无论顺序是由公式指定)将被丢弃。再深入一点:请求的模型是

    Y = b1*C1 + b2*C2 + b3*C3 + [additional terms]
    

    其中C1C2C3 是常量。在“数据空间”中附加项为 0 的点(即对于 log_a = log_b = log_c = ... = 0 的情况),我们只能从三个单独的常数项中预测一个常数值。假设常规模型 (~ 1 + log_a + log_b + log_c) 中的截距为 m。那么任何(b1, b2, b3) 的组合使总和等于零(并且有无限多个)都将同样适合数据。

    我仍然不太了解上下文,但可能值得考虑在模型中添加常数项作为 offsets。或者通过几何均值缩放预测变量/从预测变量中减去对数几何均值?


    在其他情况下,多重共线性源于无法识别的交互项;嵌套变量;尝试包括多个分类变量的所有级别;或者在模型中包括一些组成变量的所有级别的比例(例如栖息地类型的比例,其中比例加起来为1),例如

    【讨论】:

    • 谢谢本。 log_alog_gm_a 之间的关系是,这是一个乘法固定效应模型。所以log_a 是预测器a 的日志。 log_gm_aa 的几何平均值的对数。因此,每个log_gm 项在所有观察中都是恒定的。我很想听听您的回复,但我关注的关键概念是这些变量正在被删除,实际上并没有被模型用作控件。
    • 顺便说一句 - 我的理解是您从 lme4 中删除了对 quasipoisson 的支持,因为您不确定输出是否可靠。我正在研究的模型的作者坚持认为,输出不可靠的原因是未能包含转换内的术语,例如他包含在此模型中的术语。我怀疑他也搞错了……
    • 对我来说听起来很时髦。在得出结论之前,我可能需要查看整个上下文,但我对此表示怀疑。已经有很长一段时间了,IIRC 发生在我作为包的维护者完全参与之前,但我非常怀疑 Doug Bates 会错过一些相当明显的东西......
    • 如果没有直接告诉你的线人,在某处是否有关于这个模型框架的链接/信息?
    • 恐怕不是,它的商业而非学术作品。我很有信心你一针见血。谢谢本!
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