【问题标题】:Is there a way to use RDKit without Anaconda or Conda?有没有办法在没有 Anaconda 或 Conda 的情况下使用 RDKit?
【发布时间】:2022-07-13 21:40:10
【问题描述】:

RDKit 是一个用于化学的 Python 库。我不想使用 Anaconda 发行版,而且我不确定(来自文档:https://www.rdkit.org/docs/Install.html)是否有办法在没有它的情况下使用该软件包。有人可以给我一些关于在没有 conda 或安装 Anaconda 发行版的情况下安装和使用它的指导吗?

【问题讨论】:

  • 请编辑问题以将其限制为具有足够详细信息的特定问题,以确定适当的答案。

标签: python anaconda conda rdkit


【解决方案1】:

文档确实提供了installing from alternative repositories(例如homebrew)或building from source 的说明。

尽管如此,Conda 是最简单的路径,并且仅仅因为您不想要 Anaconda(我也不想要!),这不应该阻止您享受深度依赖管理带来的好处 em>Conda 提供。有一些最小且高性能的发行版,比如Mambaforge,只关注环境和包管理的用户通常会觉得更可取。另外,不要使用 base 环境来工作,而是创建一个新环境,例如

mamba create -n rdkit rdkit

【讨论】:

  • 这很有帮助,非常感谢!我仍然需要弄清楚“从源代码构建”是什么意思(如果你手头有很好的教程,我将不胜感激!)
【解决方案2】:

我已经在 Windows 11 中成功完成了这项工作。事实上,我已经将它安装在 Portable Python 3.8 中,并具有 PyMOL、Matplotlib、OpenBabel 等其他功能。此外,我还在其中添加了 Jupyter Notebook。我可以通过 Portable Jupyter Notebook 使用所有这些。无需安装 conda、anaconda 等任何东西。它运行良好。如果有兴趣,请通过 vijaymasand@gmail.com 与我联系

【讨论】:

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