从图像中提取沿线的强度分布答案

【问题标题】：extract intensity profile along a line from image从图像中提取沿线的强度分布
【发布时间】：2022-06-11 04:49:58
【问题描述】：

我有一个 numpy 数组，其中包含一些图像数据 (ch4_out)。现在，我想沿特定线（水平）提取强度分布。我正在使用 skimage 模块中的profile_line 函数来执行此操作，但出现错误。我正在寻求一些帮助来解决我的代码。

显示的错误是

order = _validate_interpolation_order(image.dtype, order)

# reading multiple images 
S01=[i for i in 
glob.glob("C:/Users/experiment/S01/*.tif")]

# Averaging images
ch4=np.array([np.array(Image.open(fname)) for fname in
S01])
ch4_avg=np.array(np.mean(ch4,axis=(0)),dtype=np.uint16)
ch4_out=Image.fromarray(ch4_avg) # image data as numpy array

#plotting figure
plt.figure()
plt.subplot(1,2,1)
plt.imshow(ch4_out,cmap='gray',interpolation='none') 
#code works fine until this point

#Now, extract intensity profile at pixel along horizontal line x (2 to 1000) at a height in vertical direction of 730 
pixels

p = profile_line(ch4_out, (2, 1000), (730, 730)) 
# coordinates for horizontal (2,1000) and vertical 
(730,730))
plt.imshow(p)
plt.show()

【问题讨论】：

哪一行面临错误？
在线p= profile_line(ch4_out,(),())。基本上，该代码适用于 .jpg 或 .png 或其他图像格式，但不适用于将图像数据作为数组的 numpy 数组（Ch4_out 是一个 numpy 数组），我更喜欢使用诸如 profile_line 之类的函数作为数组.
基于the documentation，排序很重要。这也是错误中提到的内容。你的数组是如何排序的？可以分享示例图片吗？
我已经编辑了帖子，示例图像名为 ch4_out 附加到问题中。
阵列的形状对她很重要@vashista。在ch4=np.array([np.array(Image.open(fname)) for fname in S01]) 行中，您正在形成一个数组数组，这会改变所需的输入形状

标签： python arrays numpy image-processing scikit-image