使用 Python 在特定条件下查找 RNA 的长度答案

【问题标题】：Finding the length of RNA given certain conditions using Python使用 Python 在特定条件下查找 RNA 的长度
【发布时间】：2022-02-10 15:39:46
【问题描述】：

我的任务是设计一个识别 RNA 代码长度的函数（不包括起始密码子和终止密码子）。该函数还必须确定它们的代码是否实际有效（必须包含 AUG 作为起始密码子，结尾必须包含 UGA、UAA 或 UAG）注意：RNA 以起始密码子 AUG 开头，以 UGA、UAA 或 UAG 结尾如果不满足上述条件，函数必须返回“Not readable RNA code”。

def rna_length(mrna):
    start_trans = 'AUG'

    end_trans1 = 'UAA'
    end_trans2 = 'UGA'
    end_trans3 = 'UAG'   

    if ((mrna[0:3]!=start_trans) and (mrna [-3:]!=end_trans1 or end_trans2 or end_trans3)):

        return "Not readable RNA code"  

    else:
        (mrna[0:3]==start_trans) and (mrna [-3:]==end_trans1 or end_trans2 or end_trans3)

        length = len(mrna[3:-3]) 

        return length

但此代码不适用于“AUGAGGCACCUUCUGCUCCUUAC”。它返回长度而不是“不可读”

【问题讨论】：

标签： python conditional-statements

【解决方案1】：

问题出在条件：

if ((mrna[0:3]!=start_trans) and (mrna [-3:]!=end_trans1 or end_trans2 or end_trans3)):

您只需将and 更改为or，如下所示：

if ((mrna[0:3]!=start_trans) or (mrna [-3:]!=end_trans1 or end_trans2 or end_trans3)):

这是因为如果 RNA 代码不以“AUG”开头，或如果代码不以“UAA”、“UGA”或“UAG”结尾- 它不是有效的 RNA 代码。

完整代码：

def rna_length(mrna):
    start_trans = 'AUG'

    end_trans1 = 'UAA'
    end_trans2 = 'UGA'
    end_trans3 = 'UAG'   
    if ((mrna[0:3]!=start_trans) or (mrna [-3:]!=end_trans1 or end_trans2 or 
end_trans3)):

        return "Not readable RNA code"  

    else:
        (mrna[0:3]==start_trans) and (mrna [-3:]==end_trans1 or end_trans2 or 
end_trans3)

        length = len(mrna[3:-3]) 

        return length

 def main():
     print(rna_length("AUGAGGCACCUUCUGCUCCUUAC"))
 if __name__== "__main__":
     main()

输出：

Not readable RNA code

【讨论】：

【解决方案2】：

我认为您的代码中有逻辑错误：

在您的 IF-Check 中，您要检查是否：

前三个字母是'AUG'

mrna[0:3] == start_trans

如果最后三个字母是“UAA”或“UGA”或“UAG”：

mrna[-3:] == end_trans1 or end_trans2 or end_trans3

如果两者都为真，则应返回长度。所以如果一个是假的，我们应该得到错误。

所以你的 if 检查应该是：

if (mrna[0:3] != start_trans) or (mrna[-3:] != end_trans1 or end_trans2 or end_trans3):

    return "Not readable RNA code"

对于更短的 IF 检查，我们将其写入：

end_trans = ['UAA', 'UGA', 'UAG']

if not (mrna[0:3] == start_trans or mrna[-3:] in end_trans):
    return "Not readable RNA code"`

【讨论】：

【解决方案3】：

def rna_length(mrna):
    length_of_code = len(mrna)
    
    start_codon = mrna[:3]
    stop_codon = mrna[-3:]
    
    if (start_codon == 'AUG' and (stop_codon in ('UAG', 'UAA', 'UGA'))):
        return print(f"rna_length('{mrna}') == {length_of_code - 6}")
    else:
        return "Not readable RNA code"

【讨论】：