利用DNAMAN和clusterx绘制序列比对图片

结果呈现：

 

 1、准备序列（碱基或者氨基酸）

 2、利用clusterx进行序列比对

　输入文件：

　点击： Alignment---Do complete Alignment

 

 3、比对完成之后，输出比对结果文件

     结果文件有2个：

　　**.aln 和 **dnd

 

 

 4、利用DNAMAN进行绘图

　　a) 导入刚刚比对好的文件（后缀为aln的比对文件）

　　File -- Open special --> Multiple Aligenment

　　通过option选项可以对图片进行美化

 

 5、option选项常用功能：

　　a )  ALL:选择展示的物种信息

 

 

 　　b )  选择展示颜色

 

只展示序列相似性在75%以上的序列，75%的颜色为黄色，100%的颜色为白色。