bio-mary

使用FALCON对三代测序数据进行基因组组装

ALCON是PacBio公司开发的一款用于三代基因组De novo组装软件, 更适合于大基因组的组装。

 

 

FALCON的结果文件:

0-rawreads/
该目录存放对raw subreads进行overlpping分析与校正的结果;
0-rawreads/cns-runs/cns_*/*/*.fasta存放校正后的序列信息。

1-preads_ovl/
该目录存放对校正后reads进行overlapping的结果;

2-asm-falcon/
该目录是最终结果目录,主要的结果文件是p_ctg.fa和a_ctg.fa。


参考来源:http://www.chenlianfu.com/?p=2755

分类:

技术点:

相关文章:

  • 2021-12-22
  • 2022-12-23
  • 2021-11-18
  • 2022-12-23
  • 2021-11-27
  • 2021-12-24
  • 2022-12-23
猜你喜欢
  • 2022-01-24
  • 2021-06-21
  • 2021-11-30
  • 2021-12-20
  • 2022-02-05
  • 2022-02-06
  • 2021-04-17
相关资源
相似解决方案