第一是应用及数据安全，主要包含用户敏感信息的应用系统部署在公共云上，可能存在安全隐患。企业私有云中，各个部门之间的信息安全也必须考虑，特别是财务数据、客户信息等。
第二是操作和标准化，目前云计算厂商都在各自为战，并没有统一标准。不同云之间缺乏互操作性，用户从一个云计算环境迁移到另一个环境时面临巨大的困难。
第三是服务质量保证，技术处于不断成熟过程中，质量保证和管理手段需要进一步完善。亚马逊和谷歌云服务都出现过服务中断。
第四是要求管理模式相应变化。云计算强调发挥集中化的优势，以及应用、平台和资源的分层耦合管理，面临企业传统IT系统管理和使用模式的巨大阻力。
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