与IEEE1588v1相比，IEEE1588v2最大的改进之处在于提出透明时钟模型的概念。透明时钟主要用于计算报文在网络交换设备内部的延迟，解决级联网络中的积累性误差问题，从而提髙时钟同步的精度。端到端透明时钟和点到点透明时钟都可用于计算报文在网络交换设备内部的驻留时间，但是二者对链路延迟的测量机制不同，不能够混用。
为了实现时钟同步，需要保证网络中各节点的时钟实时得到报文在传输过程中产生的延迟时间。对于路径延时的测量机制，主要分为延时请求响应机制
与对等延时机制两种。两种机制都可用于测量节点间的路径延时但是对等延时机制只能应用于所有节点均支持对等延时机制的网络系统。
IEEE1588v2中增加的透明时钟模型就对计算报文在网络交换设备内部产生的驻留时间提出了一种解决方案，并在特定PTP报文的校正域对报文在传输过程中产生的延迟进行修正，从而保证从节点与主节点之间的时钟同步精度保持在纳秒级别。