Rscript：为什么在尝试使用 raster::extract 时指示 UseMethod("extract_") 中的错误？

Question

我尝试使用 raster 包的 extract 方法从 Raster* 对象中提取值。

RStudioPrompt> jpnpe <- extract(jpnp, jpnb, fun = mean, na.rm = T)

其中 jpnp 是栅格对象，jpnb 是 SpatialPolygonsDataFrame

但是提示以下错误：

Error in UseMethod("extract_") : 
  no applicable method for 'extract_' applied to an object of class "c('RasterStack', 'Raster', 'RasterStackBrick', 'BasicRaster')"

我怎样才能通过这个错误？

Answer 1

问题可能是由于另一个包具有相同的方法名称，混淆了光栅提取方法。

tidyr 包有一个 extract 方法，可能与 raster 的 extract 方法冲突。

通过检查加载的库来确认：

>search()




[1] ".GlobalEnv"           **"package:tidyr"**        "package:dplyr"       
 [4] "package:rgeos"        "package:ggplot2"      "package:RColorBrewer"
 [7] "package:animation"    "package:rgdal"        "package:maptools"    
[10] **"package:raster"**       "package:sp"           "tools:rstudio"       
[13] "package:stats"        "package:graphics"     "package:grDevices"   
[16] "package:utils"        "package:datasets"     "package:methods"     
[19] "Autoloads"            "package:base"    

您还可以通过键入不带括号的函数名称来检查正在加载的提取方法（如下所示，环境会告诉您正在使用哪个包）：

> extract

function (data, col, into, regex = "([[:alnum:]]+)", remove = TRUE, 
    convert = FALSE, ...) 
{
    col <- col_name(substitute(col))
    extract_(data, col, into, regex = regex, remove = remove, 
        convert = convert, ...)
}
<environment: namespace:tidyr>

要解决错误 只需卸载有问题的包，在 RStudio 中您可以使用以下命令：

>.rs.unloadPackage("tidyr")

并重新执行光栅提取方法：

>jpnpe <- extract(jpnp, jpnb, fun = mean, na.rm = T)