相同的 rmd 文件在两台计算机上运行时会创建不同的乳胶文件

Question

当我和我的同事在各自的计算机上运行相同的 Rmd 文件时，它们会生成不同的 .tex 文件。这是一个问题，因为我的计算机生成的 tex 文件无法编译。显然，我们的计算机之间存在一些不可见的本地设置，但它可能是什么？我更新了我使用的所有 Rpackage，但无济于事。

Rmd 文件以

开头

output:
   bookdown::pdf_document2:
     keep_tex: yes
     toc: false 

我们俩都只需点击 Rstudio 中的 knit 按钮即可编译它。

tex 文件的显着差异是：

• 不同地方的额外换行符

• rmd 文件中被注释掉的一行 (<!-- blabla -->) 出现在我的 tex 文件中，而不是在他的文件中，但其他一些被注释掉的行都没有出现（因为它们应该出现）

• 在表格的行尾有一个\strut 插入到我的 tex 文件中，但没有插入他的

• 部门负责人在他的文件中读取\hypertaget{blabla}，但不是我的

对于所有这些差异，我都无法在 Rmd 文件中找到任何地方，可以对此做出任何选择 - 显然在此过程中使用了一些我不知道的本地设置文件？？

如果您需要更多信息，请告诉我。

编辑：我们找到了部分答案和完整解决方案，但我仍然对底层机制感兴趣。原来我使用的是旧版本的 Rstudio。 （我花了很长时间才发现这一点，因为 Rstudio 中的 check for updates 工具一直告诉我我使用的是最新版本，但这是一个单独的问题。）使用相同版本的 Rstudio 我们得到相同的结果。

Answer 1

从Rmd 到tex 的翻译有多个步骤：

• 通过knitr提取和执行所有代码块，生成md文件。
• md 文件通过pandoc 转换为tex。

对于大多数人来说，pandoc 与 RStudio 捆绑在一起。所以当你更新它时，你会得到一个更新的pandoc 版本。您可以使用rmarkdown::pandoc_version() 测试使用过的pandoc 版本。