在输出文件中捕获 Rscript 错误

【问题标题】：Capturing Rscript errors in an output file在输出文件中捕获 Rscript 错误
【发布时间】：2012-12-10 02:18:37
【问题描述】：

与类似的命令R CMD BATCH 不同，它默认生成一个输出文件，其中包含可能导致脚本执行停止的任何错误消息，我无法找到使用Rscript 执行此操作的方法。我尝试在我的 linux shell 中使用管道来实现这一点：

RScript --no-save --no-restore --verbose myRfile.R > outputFile.Rout

但这只会传递错误发生之前发生的任何输出，因此文件outputFile.R 不包含任何错误信息。有谁知道如何捕获使用RScript 执行 R 文件并将其保存到文件中发生的任何错误？

【问题讨论】：

【解决方案1】：

Rscript --no-save --no-restore --verbose myRfile.R > outputFile.Rout 2> errorFile.Rout

将输出和错误放在同一个文件中（假设是 sh/bash）

Rscript --no-save --no-restore --verbose myRfile.R > outputFile.Rout 2>&1

【讨论】：

太棒了。但是你能教育我吗？ 2> 语法是什么意思？
2> 表示重定向标准错误（文件描述符编号2）。
如果我想追加到已经存在的文件怎么办？
可以使用>> 代替> 来追加到现有文件：Rscript --no-save --no-restore --verbose myRfile.R >> outputFile.Rout 2>&1