【发布时间】:2015-06-13 00:43:28
【问题描述】:
我正在尝试在 mex 文件中使用 OpenMP 并行化我的一段 Matlab 代码。 Matlab 代码中我要并行化的部分是:
对于 i = 1 : n
D(:, i) = CALC(A, B(:,i), C(i));
end
我写这个是为了并行化它:
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[])
{
size_t r,n,i,G;
double *A, *B, *C, *D;
int nthreads;
nthreads = 4;
A = mxGetPr(prhs[0]); /* first input matrix */
B = mxGetPr(prhs[1]); /* second input matrix */
C = mxGetPr(prhs[2]);/* third input matrix */
/* dimensions of input matrices */
r = mxGetN(prhs[0]);
n = mxGetN(prhs[1]);
plhs[0] = mxCreateDoubleMatrix(r,n, mxREAL);
D = mxGetPr(plhs[0]);
G=n/nthreads;
omp_set_num_threads(nthreads);
#pragma omp parallel for schedule (dynamic, G)
{
for i = 1 : n
D(:, i) = CALC(A, B(:,i), C(i));
}
}
CALC 是我编写的一个 Matlab 函数。我的挑战是如何使用 Mexcallmatlab 将 CALC 函数调用到 mex 文件中,以便它可以在我的 mex 文件中并行执行它,并将 D 的每一列的元素(即 D(:, i) 返回到我的Matlab代码。
很抱歉这个冗长的问题。非常感谢我能得到的任何帮助。
【问题讨论】:
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我不建议在循环中调用
mexCallMATLAB,更不用说尝试使用 OpenMP。使用 MEX 的好处是,如果您重新实现CALC本身。 -
好的。让我尝试实现它。谢谢@chappjc