在每个基因序列之后添加列表项答案

【问题标题】：Add item of a list after every gene sequence在每个基因序列之后添加列表项
【发布时间】：2020-04-03 17:10:29
【问题描述】：

我已将基因组序列拆分为单独的基因，我想将它们写入文本文件。我想在每个基因序列之前添加一个标题（基因名称）。我创建了一个要添加为标题的基因名称列表。它们需要按照列表中给出的相同顺序添加。这是我试过的代码：

with open('output.txt', 'w') as f:
    for i in genes:
        for rec in i:
            for name in Features:               
                print(">" + name, file = f)
            print(rec.seq, file = f)
            print("\n", file = f)
            break

Features 是包含基因名称的列表。这段代码的输出是：

>Anchored capsid protein:
>C:
>membrane glycoprotein precursor M:
>protein PR:
>M:
>E:
>NSI:
>NS2A:
>NS2B:
>NS3:
>NS4A:
>NS4B:
>NS5:
>
ATGAATA...

什么时候应该：

>Anchored capsid protein:
ATGAATA...
>C:
ATGAATA...
>membrane protein:
TTCCATT...
>precursor:
TTCCATT...

【问题讨论】：

运行此命令时当前的输出是什么样的？最好提供一个人们可以运行并帮助改进的最小完整示例。目前我们无法运行您的代码，因为我们没有所有数据。
感谢您的建议。将添加输出
我已经编辑了这个问题，以使事情更容易阅读并格式化代码。你能添加一些示例输入吗？例如，变量genes 和Features 是什么？看看SeqIO 看看标题为序列输出的部分

标签： python-3.x bioinformatics biopython

【解决方案1】：

如果我了解您列表的结构，这可能会起作用：

with open('output.txt', 'w') as f:
    for i in genes:
        for name, rec in zip(Features, i):
            f.write(">{}\n{}\n".format(name, rec.seq))
        break

【讨论】：

谢谢，我通过在第一个 for 循环中压缩 Features 获得了输出。我的输入文件是一个 clustal 文件，如果压缩，序列将失去其 Seq 特征。感谢您的帮助