热图不显示

Question

我正在尝试从如下所示的数据框中绘制一个简单的热图：

   row column content amount
0    x      a      c1      1
2    x      b      c3      3
4    x      c      c2      1
6    y      a      c1      1
8    y      b      c3      3
10   y      c      c2      1
12   z      a      c1      1
14   z      b      c3      3
16   z      c      c2      1

row 和column 表示单元格的位置，它的颜色应该根据content 选择，我希望工具提示显示content 和amount。

我目前这样尝试（使用散景 1.2.0）：

import pandas as pd

from bokeh.io import show
from bokeh.models import CategoricalColorMapper, LinearColorMapper, BasicTicker, PrintfTickFormatter, ColorBar, ColumnDataSource
from bokeh.plotting import figure
from bokeh.palettes import all_palettes
from bokeh.transform import transform

df = pd.DataFrame({
    'row': list('xxxxxxyyyyyyzzzzzz'),
    'column': list('aabbccaabbccaabbcc'),
    'content': ['c1', 'c2', 'c3', 'c1', 'c2', 'c3'] * 3,
    'amount': list('123212123212123212')})

df = df.drop_duplicates(subset=['row', 'column'])

source = ColumnDataSource(df)

rows = df['row'].unique()
columns = df['column'].unique()
content = df['content'].unique()

colors = all_palettes['Viridis'][max(len(content), 3)]
mapper = CategoricalColorMapper(palette=colors, factors=content)

TOOLS = "hover,save,pan,box_zoom,reset,wheel_zoom"

p = figure(title="My great heatmap",
           x_range=columns, y_range=rows,
           x_axis_location="above", plot_width=600, plot_height=400,
           tools=TOOLS, toolbar_location='below',
           tooltips=[('cell content', '@content'), ('amount', '@amount')])

p.grid.grid_line_color = None
p.axis.axis_line_color = None
p.axis.major_tick_line_color = None
p.axis.major_label_text_font_size = "5pt"
p.axis.major_label_standoff = 0

p.rect(x="row", y="column", width=1, height=1,
       source=source,
       fill_color=transform('content', mapper))

# color_bar = ColorBar(color_mapper=mapper, major_label_text_font_size="5pt",
#                      location=(0, 0))
# p.add_layout(color_bar, 'right')

show(p)

但是，有两个问题：

1) 执行时，我得到一个空的热图：

有什么想法吗？

2) 当我评论 color_bar = ... 部分时，我收到一条错误消息：

ValueError: 需要一个 ContinuousColorMapper 类型的实例，得到 CategoricalColorMapper 类型的 CategoricalColorMapper(id='3820', ...)

我做错了什么？

Answer 1

你的 x 和 y 坐标被交换了，应该是：

p.rect(x="column", y="row", ...)

至于另一条消息，它是不言自明的：从 Bokeh 1.2 开始，ColorBar 只能配置连续颜色映射器（例如LinearColorMapper）。您可以：

• 在 Python 代码中自己计算颜色，并在 source 中包含一列颜色，或者
• 重新绘制您的绘图以使用 LinearColorMapper（即将 content 适当地映射到某个数字比例）

Answer 2

对于您的 colorBar，解决方案在这里，我安静地不明白您的来源发生了什么，我会再深入挖掘一下。 colorBar 需要一个连续的映射器，你给它一个分类。

from bokeh.models import (CategoricalColorMapper, LinearColorMapper, 
BasicTicker, PrintfTickFormatter, ColorBar, ColumnDataSource, 
LinearColorMapper)


factors =df['content'].unique().tolist()
colors = all_palettes['Viridis'][max(len(factors), 3)]
mapper = LinearColorMapper(palette=colors)