没有找到blastn + google colaboratory

Question

如何解决：

ApplicationError：来自'blastn -out /content/output/kitasatospora/out.txt -outfmt 6 -query /content/sequence_USA_utah.fasta -subject /content/sequence_USA_utah.fasta'，消息'/的非零返回代码 127 bin/sh: 1: blastn: not found'

Answer 1

你需要先安装它。

!apt install ncbi-blast+

然后，您可以运行blastn。