Ruby 脚本运行起来很痛苦答案

【问题标题】：Ruby script being a pain to runRuby 脚本运行起来很痛苦
【发布时间】：2021-01-11 21:41:08
【问题描述】：

我在名为 SequenceScripts 的文件夹中有一个 .gz 文件。我想解压缩它，然后在其上运行一个 ruby 脚本，重新格式化它并将其放入文本文件中。 ruby 脚本位于同一文件夹中。我正在使用 Mac 上的终端执行此操作。

我使用的命令是：

gzcat tbb.fq.gz | ./reformat_sequence_data.rb > SLX-8691.ART03.txt

我得到的回复是：env: ruby\r: No such file or directory

ruby 脚本以：

开头

#!/usr/bin/env ruby

脚本中没有回车（检查隐藏字符可见）。当我从命令行运行ruby -v 时，我得到：ruby 2.0.0p247 (2013-06-27 revision 41674) [universal.x86_64-darwin13]

我不知道发生了什么，但我怀疑额外的回车可能与它有关，但我不知道它为什么在那里。有人可以帮忙吗？

【问题讨论】：

标签： ruby bash

【解决方案1】：

我建议你还是直接运行dos2unix 或sed：

dos2unix ./reformat_sequence_data.rb
sed -i 's|\r||' ./reformat_sequence_data.rb

如果您的文件有\r (0D)，将使用以下命令显示行：

hexdump -C < ./reformat_sequence_data.rb | grep -w 0d

【讨论】：

对它进行排序很棒......有点。太烦人了，但现在使用以下方法解决了： $ cat ./reformat_sequence_data.rb | col -b > ./reformat_sequence_data.rb
@user3632206 这很危险。切勿同时打开文件进行输入和输出，因为这可能会截断文件。为什么不直接使用dos2unix 或sed？
哦，真的吗？ mac 上没有 dos2unix 并且 sed 出现了错误，所以我遵循了阻力最小的路径。似乎工作正常。对不起-不会再这样做了