Rqc 包错误：“未找到 GhostScript”

【问题标题】：Rqc package error: "GhostScript was not found"Rqc 包错误：“未找到 GhostScript”
【发布时间】：2021-05-14 16:13:54
【问题描述】：

我正在关注Rqc package documentation，所以我输入了以下内容：

library(Rqc)
folder <- system.file(package = "ShortRead", "extdata/E-MTAB-1147")
rqc(path = folder, pattern = ".fastq.gz")

但我收到以下错误：

位图错误（文件 = 文件名，宽度 = 宽度，高度 = 高度，res = 300) : 未找到 GhostScript

【问题讨论】：

【解决方案1】：

我正在运行最新版本的 RStudio (0.99.491)。首先，确保您已下载 GhostScript (here)。然后，转到安装它的目录，并找到可执行文件的路径。然后，这样做：

Sys.setenv(R_GSCMD="C:/Program Files/gs/gs9.18/bin/gswin64c.exe")

路径指的是我的特定 .exe，所以你的可能会有所不同。基本上，抛出错误的函数是在寻找R_GSCMD 来给它一个运行GhostScript 的路径。它没有找到一个，所以它抛出了一个错误。通过将R_GSCMD 设置为路径，它现在知道在哪里查找。

【讨论】：