Mongo 使用（太多）太多空间

Question

更新

一开始我有一些小型数据库，但后来我放弃了所有数据库以解决这个问题（徒劳无功）。

show dbs 显示

config  0.046875GB

但是find /var/lib/mongo -type f -print0 | sort -z | xargs -0 du -b 显示

134217728   /var/lib/mongo/a1/data/journal/j._3
88  /var/lib/mongo/a1/data/journal/lsn
134217728   /var/lib/mongo/a1/data/journal/prealloc.1
134217728   /var/lib/mongo/a1/data/journal/prealloc.2
536608768   /var/lib/mongo/a1/data/local.0
536608768   /var/lib/mongo/a1/data/local.1
536608768   /var/lib/mongo/a1/data/local.2
536608768   /var/lib/mongo/a1/data/local.3
536608768   /var/lib/mongo/a1/data/local.4
536608768   /var/lib/mongo/a1/data/local.5
536608768   /var/lib/mongo/a1/data/local.6
16777216    /var/lib/mongo/a1/data/local.ns
5   /var/lib/mongo/a1/data/mongod.lock
134217728   /var/lib/mongo/a2/data/journal/j._1
88  /var/lib/mongo/a2/data/journal/lsn
134217728   /var/lib/mongo/a2/data/journal/prealloc.1
134217728   /var/lib/mongo/a2/data/journal/prealloc.2
16777216    /var/lib/mongo/a2/data/local.0
33554432    /var/lib/mongo/a2/data/local.1
536608768   /var/lib/mongo/a2/data/local.2
536608768   /var/lib/mongo/a2/data/local.3
536608768   /var/lib/mongo/a2/data/local.4
536608768   /var/lib/mongo/a2/data/local.5
536608768   /var/lib/mongo/a2/data/local.6
536608768   /var/lib/mongo/a2/data/local.7
536608768   /var/lib/mongo/a2/data/local.8
16777216    /var/lib/mongo/a2/data/local.ns
5   /var/lib/mongo/a2/data/mongod.lock
134217728   /var/lib/mongo/b1/data/journal/j._4
88  /var/lib/mongo/b1/data/journal/lsn
134217728   /var/lib/mongo/b1/data/journal/prealloc.1
134217728   /var/lib/mongo/b1/data/journal/prealloc.2
536608768   /var/lib/mongo/b1/data/local.0
536608768   /var/lib/mongo/b1/data/local.1
536608768   /var/lib/mongo/b1/data/local.2
536608768   /var/lib/mongo/b1/data/local.3
536608768   /var/lib/mongo/b1/data/local.4
536608768   /var/lib/mongo/b1/data/local.5
536608768   /var/lib/mongo/b1/data/local.6
16777216    /var/lib/mongo/b1/data/local.ns
5   /var/lib/mongo/b1/data/mongod.lock
16384   /var/lib/mongo/b2/data/journal/j._1
88  /var/lib/mongo/b2/data/journal/lsn
16777216    /var/lib/mongo/b2/data/local.0
33554432    /var/lib/mongo/b2/data/local.1
536608768   /var/lib/mongo/b2/data/local.2
536608768   /var/lib/mongo/b2/data/local.3
536608768   /var/lib/mongo/b2/data/local.4
536608768   /var/lib/mongo/b2/data/local.5
536608768   /var/lib/mongo/b2/data/local.6
536608768   /var/lib/mongo/b2/data/local.7
536608768   /var/lib/mongo/b2/data/local.8
16777216    /var/lib/mongo/b2/data/local.ns
5   /var/lib/mongo/b2/data/mongod.lock
16777216    /var/lib/mongo/config/data/config.0
33554432    /var/lib/mongo/config/data/config.1
16777216    /var/lib/mongo/config/data/config.ns
134217728   /var/lib/mongo/config/data/journal/j._0
88  /var/lib/mongo/config/data/journal/lsn
134217728   /var/lib/mongo/config/data/journal/prealloc.1
134217728   /var/lib/mongo/config/data/journal/prealloc.2
5   /var/lib/mongo/config/data/mongod.lock

没有数据的情况下超过 17GB！ 哎呀。

为什么 Mongo 占用这么多空间，我该如何减少它？

Answer 1

这些文件是什么？

看起来在您的环境中进行初始安装的人创建了一个sharded cluster，这可能是两个分片，每个分片由replica set 中的两个数据承载节点支持。他们选择在/var/lib/mongo/ 的公共路径下为每个节点创建子目录。

根据子目录名称，我猜a1 和a2 是分片a 的副本集，b1 和b1 是分片b 的副本集的一部分。如果您好奇，您可能可以通过检查仍然存在的config database 来确认之前的配置。

在一种情况下，在副本集中，每个承载数据的节点都有一个预分配的oplog (operation log)，用于复制。 oplog 存储在local 数据库的oplog.rs 集合中。

默认情况下，oplog size 是可用磁盘空间的 5%（至少在 64 位 Linux 系统上），这就是为什么尽管有一个“空”数据库，它们仍会占用大量磁盘。

如何安全地清理这个数据目录？

如果您只运行一个 MongoDB 实例，默认情况下它将忽略额外的子目录及其内容。这就是为什么你仍然有额外的磁盘使用 - 你已经删除了你的 mongod 知道的所有数据库。

如果您想“重置”所有数据并重新开始，您应该：

• 停止正在运行的mongod 实例，例如：sudo service mongod stop
• 注意：如果您想更加确定之前的分片安装中没有延迟的mongod 进程，您也可以运行：killall mongod; killall mongos
• 切换到数据目录：cd /var/lib/mongo/
• 确保您在预期的目录中：pwd
• 删除所有文件：rm -r *
• 重启mongod，例如：sudo service mongod start