将 Pajek 数据集读入 Networkx答案

【问题标题】：Reading a Pajek Dataset into Networkx将 Pajek 数据集读入 Networkx
【发布时间】：2014-04-22 07:59:58
【问题描述】：

我希望将 Pajek 数据集转换为 networkx Graph()。数据集来自哥斯达黎加Family Ties。我正在使用非常方便的networkx.read_pajek(pathname) 函数，但遇到了一些麻烦。切换到正确的目录后，我在终端窗口 (iPython) 上执行以下命令，导入 networkx as nx 和 matplotlib.pyplot as plt：

>> G = nx.read_pajek('SanJuanSur.paj')
>> nx.draw(G)
>> fig = plt.figure(figsize = (15, 10))
>> nx.draw(G)
>> plt.show()

发生了一些不寻常的事情——很明显，希望有经验的人能够帮助我。看起来.paj 文件有许多不同的部分卡在我下载的一个文件中。由于没有 cmets，因此不太确定如何分解它，而且似乎 Pajek 通常是为了使用 GUI 进行操作。

>> G.node['f49']
{'id': '49', 'shape': '0.5000', 'x': 0.5533, 'y': 0.3766}

希望使用节点的状态（属性范围为 0-14）。谢谢！

【问题讨论】：

标签： networkx

【解决方案1】：

networkx Pajek 文件阅读器无法处理其中包含额外“分区”数据的 .paj 格式文件。不幸的是，它似乎有效。但显然你得到了额外的节点和边。

如果您删除文件 SanJuanSur2.net 中从 *Edges 开始到最后的所有内容，您可以使用 networkx.read_pajek() 读取它。

【讨论】：

感谢您的回复！我有点想通，但一直在坚持寻找简单修复的可能性。