如何读取 tif 文件的一小部分以加快导入速度？

【问题标题】：How can I read a subsection of tif files for faster import?如何读取 tif 文件的一小部分以加快导入速度？
【发布时间】：2016-05-20 19:56:33
【问题描述】：

我需要循环读取数千个 TIF 文件（大小为 3500x3500）。

而imread是最大的瓶颈。我只处理我拥有 row-col 范围的图像的一小部分。

是否可以导入图像的一部分以显着改进导入过程？还有其他建议吗？

这是代码的导入部分：

for m = 1:length(pFileNames)
    if ~exist(precipFileNames{m}, 'file')
        continue;
    end
    pConus = imread(pFileNames{m});
end

附：我尝试使用 PixelRegions。但我有 Matlab 2014，我得到这个错误：

Undefined function or variable 'PixelRegion'.

【问题讨论】：

【解决方案1】：

考虑在命令行中使用 vips 从每个图像中提取您想要的区域，命令如下：

vips extract_area INPUT.TIF OUTPUT.TIF left top width height

然后将其与 GNU Parallel 结合，一次执行 4 或 8 个，如下所示：

parallel vips extract_area {} sub_{} left top width height ::: *.tif

我建议您在开始实验之前先备份...

基准时间

我创建了 1,000 张随机数据的 TIF 图像，所有图像的大小均为 3,500x3500 像素，然后运行上面的 GNU Parallel + vips 命令，从 1,000 个 TIF 中的每一个中提取 100x100 像素的区域。

在合理规格的 iMac 上，1000 个子图像在 11 秒内被提取并写入磁盘。

【讨论】：