在一行中合并两个 sed 命令答案

【问题标题】：Combine two sed commands in one line在一行中合并两个 sed 命令
【发布时间】：2016-03-02 18:57:54
【问题描述】：

我正在寻找一个in place 命令来更改所有以:.:. 结尾的文件行

来自

chr01   1453173 .   C   T   655.85  PASS    .   GT:AD:DP:PGT:PID    0/1:25,29:54:.:.

到

chr01   1453173 .   C   T   655.85  PASS    .   GT:AD:DP    0/1:25,29:54

换句话说，我基本上是从任何以:.:. 结尾的行中删除:PGT:PID 和:.:.

【问题讨论】：

标签： unix awk sed

【解决方案1】：

使用 GNU sed 和 Solaris sed：

sed '/:\.:\.$/{s///;s/PGT:PID//;}' file

如果您想使用 GNU sed “就地”编辑您的文件，请使用选项 -i。

【讨论】：

【解决方案2】：

使用 awk 会是：

awk 'sub(/:\.:\.$/,""){sub(/:PGT:PID/,"")} 1' file
chr01   1453173 .   C   T   655.85  PASS    .   GT:AD:DP    0/1:25,29:54

对于使用 gawk 进行就地编辑，您可以添加 -i inplace 选项，而对于任何 awk，您只需添加 > tmp && mv tmp file。

【讨论】：

【解决方案3】：

您正在寻找类似的东西：

sed -i.bak "/^.*:\.:\.$/ {s/:PGT:PID//g; s/:\.:\.//g;}" file

它确实就地替换为文件并创建一个作为 file.bak 的备份
/^.*:\.:\.$/ 将 s 命令限制为以 :.:. 结尾的行，. 需要引用，因为它们是正则表达式的特殊字符
s sommand 将字符串替换为空字符串

【讨论】：

@EdMorton 感谢您的建议，我改进了答案。

【解决方案4】：

作为单行：

sed -i -e '/:\.:\.$/!n' -e 's///' -e 's/:PGT:PID//g' "$file"

扩展：

/:\.:\.$/!n     # leave lines untouched unless they end in ":.:."
s///            # replace the matched ":.:." with nothing
s/:PGT:PID//g   # replace ":PGT:PID" with nothing, everywhere

我们使用-i 标志来执行就地编辑。我们将每一行作为单独的 -e 表达式传递以实现可移植性：一些 sed 实现允许将多个命令与 ; 连接，但这不是 POSIX 标准所要求的。

【讨论】：