使用 sed、awk、cut 替换任何以符号 @ 开头的行答案

【问题标题】：replace any line that starts with the symbol @ using sed, awk, cut使用 sed、awk、cut 替换任何以符号 @ 开头的行
【发布时间】：2015-03-21 03:59:03
【问题描述】：

这很简单，但我希望有一个快速命令（最好使用 sed、cut、awk 或 BASH 中的其他东西）来执行此操作：

替换任何以符号@开头的行：

@<text, on one line, including numbers, letters and colons>

与

@<text, on one line, including numbers, letters and colons>/1

@ 始终保持一致，<text, on one line, including numbers, letters and colons> 发生变化。（这是面向生物信息学家的 Fastq 格式）。

例子：

@HWI-D00193:58:H73UEADXX:1:1101:1516:2209 1:N:0:ATCACG

改成

@HWI-D00193:58:H73UEADXX:1:1101:1516:2209 1:N:0:ATCACG/1

我知道这很简单抱歉。

【问题讨论】：

在寻找更广泛的问题时遇到了这个问题：如何替换整行，用cat file | sed 's/^.*STRING_TO_BE_REPLACED.*$/LINE_TO_REPLACE_WITH/' >new_file回答here
有趣的是，来这里也是为了寻找FASTQ的转换

【解决方案1】：

使用sed，您可以执行以下操作：

sed "/^@/ s/$/\/1/g" file

这匹配以@ 开头的行，然后在所有匹配行上附加（在末尾替换）/1。

【讨论】：

【解决方案2】：

使用awk

awk '/^@/ {$0=$0"/1"}1' file

【讨论】：