漂亮地打印一个空格分隔的文件[重复]答案

【问题标题】：Pretty print a space delimited file [duplicate]漂亮地打印一个空格分隔的文件[重复]
【发布时间】：2018-04-14 02:29:17
【问题描述】：

我有一个来自 R 的文件。它基本上是 write.table 命令的输出，使用分隔符 " "。此文件的示例如下所示：

file1.txt
5285 II-3 II-2 2 NA NA NA NA 40 NA NA c.211A>G
8988 III-3 III-4 1 NA NA NA NA NA NA NA c.211A>G
8F412 III-3 III-4 2 NA NA 28 NA NA NA NA c.211A>G
4H644 III-3 III-4 2 NA NA NA NA NA NA NA NA

我需要的是一个非常特定格式的新文件，基本上我需要使用空格对齐所有列，我不能使用制表符。

所需的输出将是

5285   II-3   II-2  2 NA NA NA NA 40 NA NA c.211A>G
8988   III-3  III-4 1 NA NA NA NA NA NA NA c.211A>G
8F412  III-3  III-4 2 NA NA 28 NA NA NA NA c.211A>G
4H644  III-3  III-4 2 NA NA NA NA NA NA NA NA

因此，在第一行5285 和II-3 之间将有3 个空格，而在第三行8F412 和III-3 之间只有两个空格。第一个树字段的长度可以不同，但是其余列的长度始终是固定的（两个字符），但最后一个可以是 12 个字符

我可以在文本编辑器中执行此操作，但我有一个非常大的文件，我想使用 bash、awk 或 R 来执行此操作

【问题讨论】：

使用awk和printf。
@codeforester，我的awk知识很基础，能发个例子吗？
你可以看看这个文档：gnu.org/software/gawk/manual/html_node/Printf-Examples.html

标签： bash awk formatting

【解决方案1】：

使用column:

$ column -t file
5285   II-3   II-2   2  NA  NA  NA  NA  40  NA  NA  c.211A>G
8988   III-3  III-4  1  NA  NA  NA  NA  NA  NA  NA  c.211A>G
8F412  III-3  III-4  2  NA  NA  28  NA  NA  NA  NA  c.211A>G
4H644  III-3  III-4  2  NA  NA  NA  NA  NA  NA  NA  NA

【讨论】：

【解决方案2】：

这是另一种方法

$ tr ' ' '\t' <file | expand -t2

5285  II-3  II-2  2 NA  NA  NA  NA  40  NA  NA  c.211A>G
8988  III-3 III-4 1 NA  NA  NA  NA  NA  NA  NA  c.211A>G
8F412 III-3 III-4 2 NA  NA  28  NA  NA  NA  NA  c.211A>G
4H644 III-3 III-4 2 NA  NA  NA  NA  NA  NA  NA  NA

【讨论】：

【解决方案3】：

使用awk，以便您可以严格控制每个字段的格式：

awk '{ printf("%-5s %-5s %-5s %s %s %s %s %s %s %s %s %s\n", $1, $2, $3, $4, $5, $6, $7, $8, $9, $10, $11, $12) }' file

生产：

5285  II-3  II-2  2 NA NA NA NA 40 NA NA c.211A>G
8988  III-3 III-4 1 NA NA NA NA NA NA NA c.211A>G
8F412 III-3 III-4 2 NA NA 28 NA NA NA NA c.211A>G
4H644 III-3 III-4 2 NA NA NA NA NA NA NA NA

【讨论】：