glmmadmb 帮助：运行模型时出现多个错误答案

【问题标题】：glmmadmb help: multiple errors when running modelsglmmadmb 帮助：运行模型时出现多个错误
【发布时间】：2017-02-21 09:20:27
【问题描述】：

我正在尝试运行一个混合效应模型，其中包括三个具有交互作用的固定效应以及一个随机截距和斜率。我试图在 glmmadmb 中指定的模型是：

> fit_zipoiss_ambig<-glmmadmb(AmbigCount~Posn.c*mood.c*Valence.c + offset(InputAmbig) + (1+Valence.c|mood.c/Chain), data = Data, zeroInflation = TRUE, family="poisson")

首先我收到此错误消息：

Error in Droplevels(eval(parse(text = x), data)) : 
  all grouping variables in random effects must be factors

所以我使用（作为示例）fPosn.c=as.factor(Data$Posn.c)将我的所有预测变量转换为因子。然后我运行了这个模型：

> fit_zipoiss_ambig<-glmmadmb(AmbigCount~fPosn.c*fmood.c*fValence.c + offset(InputAmbig) + (1+fValence.c|fmood.c/Chain), data = Data, zeroInflation = TRUE, family="poisson")

然后我得到了这个错误：

Error in glmmadmb(AmbigCount ~ fPosn.c * fmood.c * fValence.c + offset(InputAmbig) +  : 
  The function maximizer failed (couldn't find STD file) Troubleshooting steps include (1) run with 'save.dir' set and inspect output files; (2) change run parameters: see '?admbControl'
In addition: Warning message:
running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c "C:/Program Files/R/R-3.2.2/library/glmmADMB/bin/windows64/glmmadmb.exe" -maxfn 500 -maxph 5 -noinit -shess' had status 1

我尝试遵循故障排除建议，因此在我的模型末尾添加了, admb.opts=admbControl(shess=FALSE,noinit=FALSE))。现在我收到此错误：

Error in glmmadmb(AmbigCount ~ fPosn.c * fmood.c * fValence.c + offset(InputAmbig) +  : 
  rank of X = 106 < ncol(X) = 107

我不知道这个错误是什么意思。我希望有人可以帮助我解决如何在 glmmadmb 中指定我的模型或失败，其他一些包将允许我测试泊松或负二项分布。

【问题讨论】：

标签： r mixed-models poisson

【解决方案1】：

无法自己运行它，让我跳出来的是：

就您的第一条错误消息而言，它是说嵌套随机效应公式中的变量需要是因子。
然后，在您的代码中：fPosn.c=as.factor(Data$Posn.c) 您没有在数据框中创建“fPosn.c”。为此，您需要运行： Data$fPosn.c = as.factor(Data$Posn.c)

【讨论】：