【发布时间】:2018-03-05 17:26:31
【问题描述】:
我需要使用 ranger 函数绘制变量重要性,因为我有一个大数据表,而 randomForest 在我的研究案例中不起作用。
这是我的代码:
library(ranger)
set.seed(42)
model_rf <- ranger(Sales ~ .,data = data[,-1],importance = "impurity")
然后我创建新的数据框DF,其中包含来自上面的代码,如下所示
> v<-as.vector(model_rf$variable.importance$Importance)
> w<-(as.vector((row.names(df))))
> DF<-cbind(w,v)
> DF<-as.data.frame(DF)
> DF
w v
1 DayOfWeek 376393213095.426
2 Customers 1364058809531.96
3 Open 634528877741.021
4 Promo 261749509069.205
5 StateHoliday 5196666310.34041
6 SchoolHoliday 6522969049.3763
7 DateYear 7035399071.0376
8 DateMonth 20134820116.2625
9 DateDay 37631766745.2306
10 DateWeek 32834962167.9479
11 StoreType 31568433413.5718
12 Assortment 20257406597.8358
13 CompetitionDistance 111847579772.77
14 CompetitionOpenSinceMonth 46332196019.0118
15 CompetitionOpenSinceYear 45548903472.6485
16 Promo2 0
17 Promo2SinceWeek 50666744628.7906
18 Promo2SinceYear 40964066303.0407
19 CompetitionOpen 39927447341.0351
20 PromoOpen 28319356095.063
21 IspromoinSales 2844220121.08598
但是我需要根据上面显示的结果来绘制这样的图表:
编辑
正如@Sam 建议的那样,我尝试修改此代码:
> ggplot(DF, aes(x=reorder(w,v), y=v,fill=v))+
+ geom_bar(stat="identity", position="dodge")+ coord_flip()+
+ ylab("Variable Importance")+
+ xlab("")+
+ ggtitle("Information Value Summary")+
+ guides(fill=F)+
+ scale_fill_gradient(low="red", high="blue")
但我收到此错误:
错误:将离散值提供给连续刻度另外:还有 有 42 个警告(使用 warnings() 来查看) >
请问我该怎么做? 提前谢谢!
【问题讨论】:
-
请以我们可以直接读取的格式粘贴您的数据框。比如pastebin.com
-
@Axeman,来自
library(ranger) -
类似
ggplot(stack(model_rf$variable.impotance), aes(ind, values)) + geom_col() + coord_flip() -
@Axeman,不,它不起作用
-
@Sam,请看编辑后的问题