如何编辑和调试 R 库源答案

【问题标题】：How to edit and debug R library sources如何编辑和调试 R 库源
【发布时间】：2021-10-07 10:18:00
【问题描述】：

我在我的 R 脚本中包含了一个名为blotter 的库，其中有一个错误。是否有一种简单的方法可以让我编辑源代码以尝试调试问题？

【问题讨论】：

r modify and rebuild package的可能重复

标签： r

【解决方案1】：

查找trace 和browser 函数，它们是R 中用于调试的基本工具。说要编辑函数foo的源代码，然后说

trace("foo",edit=TRUE)

将在编辑器中打开 foo 的源代码供您更改。但是，这是用于交互式调试；包中的源文件没有改变。因此，一旦发现错误，您需要更改包源文件以使更改永久生效。

【讨论】：

嗨！我已经下载了一个包，并且我知道我必须编辑的功能 - 我只是在所有文件中找不到它。这样做的正确方法是什么？你能指出我正确的方向吗？
我认为值得一提的是，一旦你有了编辑过的源代码，你就可以简单地将它分配给一个新函数。这样，在您的代码中就可以明确表明您使用的是原始包的修改版本。

【解决方案2】：

R 的开发版本（2010 年 7 月 16 日）实现了这样的功能：

在 r-devel 中添加了一个新工具，供作者进行实验包。

这个想法是将修改后的代码从包源插入到无需重新安装即可运行包。所以一个人可以改变，测试，改变，等快速循环。

该机制是评估一些源代码文件，返回一个环境对象，它是代码的快照。由此环境、函数和方法可以插入到环境中当前会话中的包。插入使用 trace() 机制，所以可以恢复原来的代码。

一步法是：

insertSource("mySourceFile.R", package = "myPackage", functions = "foo")

更多详情请参阅此帖子：Inserting and testing revised functions in a package

【讨论】：

【解决方案3】：

您对我是否有一种简单的方法可以编辑源代码以尝试调试问题？ 有一个明显的答案：使用源代码，Luke！

blotter 是R-Forge 上的一个包，您可以从中获取blotter sources here。这是看待开源的标准方式，可能会帮助它修复错误。

【讨论】：

好的，我该怎么做？通常我可以只调用“库”，我假设我无法使用这些资源。我下载了源代码，但是有将近 40 个文件。我是否对它们中的每一个单独运行“源”以将它们放入我的脚本中？
@Ben McCann 假设没有 C 或 FORTRAN 代码，您可以提取 R 文件，source() 它们并从那里工作（每次更改文件时，您必须获取它或将其复制/粘贴到R)。一切就绪后，您可以将文件复制回包二进制文件并构建它。我在博客文章中描述了一个快速的 R 包构建：danganothererror.wordpress.com/2010/07/23/…