将 .mat 文件转换为 XML - 需要添加 java 类？

Question

我想将一些 MAT 文件转换为 XML（每个 .mat 文件都包含一个层次结构），以便我可以从其他软件（如 R、Python）访问数据。这些 MAT 文件是在 Matlab 6.5 中生成的，因此它们不在 HDF5 数据格式规范中。有一个用户贡献的 XML 工具箱（从 2003 年开始），它表明从 MAT 到 XML 的简单转换是可能的：

http://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/4278

但我似乎在使用 xml_format 函数时遇到了错误：

??? NaN's cannot be converted to logicals.

我尝试转换的数据结构嵌套在具有多种数据类型（数组等）的多个级别上，因此我可能必须编写自己的导出函数。我正在使用 Matlab 版本 7.10.0.499 (R2010a) 64 位 (maci64) 所以我应该可以使用 xmlwrite 和 xmlread 函数：

http://www.mathworks.com/help/techdoc/import_export/f5-86078.html#bsmnj5u

但是，当我尝试效仿他们时，

docNode = com.mathworks.xml.XMLUtils.createDocument('root_element')

我收到一个错误：

??? Undefined variable "com" or class

如果我尝试查看加载了哪些 java 类，我会得到

[M,X,J] = inmem;
J = 

    'MException'

虽然在我的$matlabroot/toolbox/local/classpath.txt 中似乎加载了很多 Java 类。

我是否需要安装 Java 模块或添加额外的路径，或其他东西才能使其正常工作？或者您有什么建议可以从 MAT 转到另一种允许任意嵌套结构（其中一些包含图像的数组表示）的常见数据交换格式？我没有看到太多 MAT 到 HDF5 转换的方式，这似乎也是从 MAT 到 XML 的合理替代方案......谢谢~

Answer 1

由于较新的 mat 文件只是行/列翻转的 HDF5 文件，您可以编写新的 matlab 将其放入 HDF5。

要将旧的 mat 文件转换为较新的 HDF5 格式，只需在 matlab 中打开它们并重新保存

s=open('AFile.mat')
save('AFile.mat','-struct','s')

差不多

你也可以探索hdf5write函数