错误：评估嵌套太深：无限递归/选项（表达式=）？根茎

Question

我正在尝试在一组 729 个菌株中在 R 中运行 rhierbaps，这是我正在使用的代码（与用于程序的示例中的代码完全相同）：

#load data
fasta.rhierBAPS_Ef <- system.file("extdata", "Concatenated.fas", package = "rhierbaps")

#SNP Matrix
snp.matrix <- load_fasta(fasta.rhierBAPS_Ef)

#rhierBAPS
hb.results <- hierBAPS(snp.matrix, max.depth = 2, n.pops = 10, n.extra.rounds = Inf, 
                       quiet = TRUE)

当我这样做时得到错误：

Error: evaluation nested too deeply: infinite recursion / options(expressions=)?
Error during wrapup:

然后 Rstudio Blocks and aborts...

你能帮我解决这个问题吗？

Answer 1

您错误地指定：n.pops = 0 使用正整数作为上限，它会起作用。