如何从 agnes 中提取聚类中心以输入 kmeans？答案

【问题标题】：How to extract cluster centres from agnes for inputting into kmeans?如何从 agnes 中提取聚类中心以输入 kmeans？
【发布时间】：2015-06-09 04:27:21
【问题描述】：

One recommended method 要获得良好的聚类解决方案，首先使用层次聚类方法，选择多个聚类，然后提取质心，然后将其重新运行为预先指定中心的 K-means 聚类算法。一个玩具例子：

library(cluster)
data(animals)
ag.a  <- agnes(agriculture, method = "ward")
ag.2 <- cutree(ag.a, k = 2)

这会给我两个集群。如何以一种格式提取聚类中心，然后将其放入kmeans() 算法并将其重新应用于相同的数据？

【问题讨论】：

标签： r cluster-analysis

【解决方案1】：

您可以使用聚类来分配聚类成员资格，然后计算聚类中所有观测值的中心。如果传入矩阵，kmeans 函数允许您通过 centers= 参数指定初始中心。你可以这样做

library(cluster)
data(animals)
ag.a  <- agnes(agriculture, method = "ward")
ag.2 <- cutree(ag.a, k = 2)

# calculate means per group
cent<-aggregate(cbind(x,y)~ag.2, agriculture, mean)
# pass as initial centers
kmeans(agriculture, cent[,-1])

【讨论】：