使用 Nextflow 压缩文件时出现问题

Question

我尝试在 Nextflow 管道中压缩后缀为“.js”的文件。 我的问题是“result.tar.gz”存档只包含指向原始文件的软链接，而不是实际文件。

有人知道这个问题的答案吗？

我的示例代码：

#!/usr/bin/env nextflow

a_ch  = Channel
    .fromPath('a.js')

b_ch = Channel
    .fromPath('b.js')

process testTar {
    publishDir "." ,mode: 'copy' , pattern: "*.tar.gz"

    input:
    path "a.js" from a_ch
    path "b.js" from b_ch

    output:
    path("result.tar.gz") into results_ch

    """
    tar -czvf "result.tar.gz" *.js
    """
}

提前谢谢你。

Answer 1

我不知道你有什么 tar，但请尝试在选项中添加 h，例如-chzvf，取消引用符号链接。