使用 pandas 在 Python 中创建和绘制层次树答案

【问题标题】：Creating and graphing Hierarchical Trees in Python with pandas使用 pandas 在 Python 中创建和绘制层次树
【发布时间】：2015-10-09 19:09:35
【问题描述】：

所以我在 pandas DataFrame 中存储了分层信息，我想根据这些信息构建和可视化分层树。

例如，我的 DataFrame 中的一行具有列标题 — ['门','类','目','科','属','种','亚种']

我想为每一行创建一棵树，其中所有“亚种”都是唯一的字符串，应该是树中的叶子。有人可以指出我这样做的最佳方法/包等吗？理想情况下，输出将是一个 matplotlib 对象。提前谢谢！

【问题讨论】：

标签： python matplotlib pandas tree hierarchical-clustering

【解决方案1】：

您可以使用 groupby 轻松地将它们放入分层索引中：

taxons = ['Phylum','Class','Order','Family','Genus','Species','Subspecies']
hierarchical_df = my_dataframe.groupby(taxons).sum() #sum or whatever is most appropiate for your data

从那里开始，我也在尝试制作一个有意义的情节来展示这种层次结构（见Hierarchic pie/donut chart from Pandas DataFrame using bokeh or matplotlib?）

【讨论】：