使用逻辑向量替换列中的值答案

【问题标题】：Replace values in column using logical vector使用逻辑向量替换列中的值
【发布时间】：2018-11-13 12:36:28
【问题描述】：

我有一个长格式的数据框。 OTU 列有大约 428 个唯一 ID，重复测量导致 26,536 行。

'data.frame':   26536 obs. of  18 variables:
 $ OTU        : chr  "109431" "109431" "109431" "109431" ...
 $ Sample     : chr  "m.ch.45" "m.ch.59" "m.ch.85" "m.ch.51" ...
 $ Abundance  : num  0.994 0.983 0.981 0.975 0.975 ...
 $ X.SampleID : Factor w/ 62 levels "m.ch.1","m.ch.101",..: 28 37 52 33 
                                                8 15 13 7 58 14 ...
 $ Family     : Factor w/ 89 levels 
    "f__","f__[Acidaminobacteraceae]",..: 26 26 26 26 26 26 26 26 26 26 
                                              ...

在 OTU 列中的唯一 ID 中，我想重点关注其中的 9 个（top9names）。我制作了一个逻辑向量，前 9 名中的所有 OTU 为 TRUE，所有不为 FALSE 的 OTU

matches <- qd_melted$OTU %in% top9names

对于这 9 个 OTU 名称，我想保留相应的家族名称（第 5 列）。对于其他 OTU 名称（~419），我想将 Family 列中的值替换为“Other taxa”。关于如何编码的任何提示？

【问题讨论】：

标签： r dataframe replace

【解决方案1】：

向因子添加新值时，您需要先更新水平。这是一种方法-

levels(qd_melted$Family) <- c(levels(qd_melted$Family), "Other taxa")

qd_melted$Family[!matches] <- "Other taxa"

【讨论】：