ValueError：无法将具有非唯一 MultiIndex 的 DataFrame 转换为 xarray答案

【问题标题】：ValueError: cannot convert a DataFrame with a non-unique MultiIndex into xarrayValueError：无法将具有非唯一 MultiIndex 的 DataFrame 转换为 xarray
【发布时间】：2023-03-28 11:10:01
【问题描述】：

这些是我要转换的数据，它们保存在 CSV 中。而且有些经纬度可能是重复的，实际上是从NetCDF文件中提取出来的。

lon
Out[56]: 
0       121.25
1       121.75
2       122.25
3       122.75
4       123.25
 
3819    109.75
3820    110.25
3821    108.75
3822    109.25
3823    109.75
Name: E, Length: 3824, dtype: float64
lat
Out[57]: 
0       53.25
1       53.25
2       53.25
3       53.25
4       53.25
 
3819    19.25
3820    19.25
3821    18.75
3822    18.75
3823    18.75
Name: N, Length: 3824, dtype: float64
pr
Out[58]: 
0       136.094444
1        95.242593
2       120.557407
3        92.844444
4       106.596296
   
3819    176.818519
3820    512.942593
3821    271.687037
3822    359.205556
3823    242.946296
Name: annual, Length: 3824, dtype: float64

所以我想将它们转换为 xarray，因为我需要 'pr' 是 2D（没有重复的 long 或 lat），如下面的。

<xarray.DataArray 'Temperature_surface' (lat: 153, lon: 257)>
array([[258.67383, 258.57382, 258.87384, ..., 249.67383, 246.57382, 244.97383],
       [258.57382, 258.77383, 258.67383, ..., 245.27383, 246.77383, 251.47383],
       [258.57382, 258.47382, 258.27383, ..., 246.67383, 246.07382, 251.47383],
       ...,
       [300.77383, 300.77383, 300.67383, ..., 302.37384, 302.27383, 302.27383],
       [300.87384, 300.77383, 300.67383, ..., 302.37384, 302.37384, 302.27383],
       [300.87384, 300.97382, 300.97382, ..., 302.37384, 302.37384, 302.27383]],
      dtype=float32)
Coordinates:
  
  * lat       (lat) float32 56.0 55.75 55.5 55.25 55.0 ... 18.75 18.5 18.25 18.0
  * lon       (lon) float32 72.0 72.25 72.5 72.75 ... 135.2 135.5 135.8 136.0

这是我的代码：

import pandas as pd


data=pd.read_csv('E:\Desktop\Data Processing\Correct New\CSV\China_R95P.csv')
lon=data['E']
lat=data['N']
pr=data['annual']
df=pd.DataFrame({
    'lon':lon,
    'lat':lat,
    'pr':pr
    })
df=df.set_index(['lon','lat'])

df是这样的

Out[97]: 
                      pr
lon    lat              
121.25 53.25  136.094444
121.75 53.25   95.242593
122.25 53.25  120.557407
122.75 53.25   92.844444
123.25 53.25  106.596296
                 ...
109.75 19.25  176.818519
110.25 19.25  512.942593
108.75 18.75  271.687037
109.25 18.75  359.205556
109.75 18.75  242.946296

[3824 rows x 1 columns]

然后当我使用 df.to_xarray() 我收到了错误ValueError: cannot convert a DataFrame with a non-unique MultiIndex into xarray

我该怎么办？感谢您的回答！

【问题讨论】：

标签： python pandas python-xarray

【解决方案1】：

正如您的错误所说，您有一个非唯一索引。这会导致 xarray 出现问题，因为您可能会向其发送相互矛盾的数据。每个经度和纬度都应该有一个唯一的值。因此，您要么需要删除重复项，要么需要平均每个 lon/lat 中的值。如果您只是有重复项，则以下内容将起作用：

df=df.drop_duplicates.reset_index(drop=True)

【讨论】：

非常感谢。但是当我将df 转换为xarray 时，所有pr 都变成nan。怎么回事？