如何从 NCEI THREDDS 服务器下载和子集 netCDF 文件

Question

我正在尝试下载和子集位于此处的文件：https://www.ncei.noaa.gov/thredds-ocean/catalog/ncei/archive/data/0129374/daily/catalog.html，但我不确定我是否做错了，或者链接是否有问题。这是我第一次从这个服务下载数据，所以我不能确切地知道。

如果我将鼠标悬停在我看到的第一个文件的链接上：https://www.ncei.noaa.gov/thredds-ocean/catalog/ncei/archive/data/0129374/daily/catalog.html?dataset=ncei/archive/data/0129374/daily/livneh_NAmerExt_15Oct2014.195001.nc

我尝试使用 pydap 打开此网址：

from pydap.client import open_url

open_url('https://www.ncei.noaa.gov/thredds-ocean/catalog/ncei/archive/data/0129374/daily/catalog.html?dataset=ncei/archive/data/0129374/daily/livneh_NAmerExt_15Oct2014.195001.nc')

但我得到了错误：

webob.exc.HTTPError: 404 Not Found

如果我使用 netCDF4 库，我会得到一个不同的错误：

import netCDF4

netCDF4.Dataset('https://www.ncei.noaa.gov/thredds-ocean/catalog/ncei/archive/data/0129374/daily/livneh_NAmerExt_15Oct2014.195001.nc')

这给了我：

OSError：[Errno -75] NetCDF：格式错误或意外约束： b'https://www.ncei.noaa.gov/thredds-ocean/catalog/ncei/archive/data/0129374/daily/catalog.html?dataset=ncei/archive/data/0129374/daily/livneh_NAmerExt_15Oct2014.195001。无'

链接可能有问题吗？如何下载这些数据并对其进行子集化？

Answer 1

目前你使用了错误的文件。您需要使用 OPENDAP 链接：https://www.ncei.noaa.gov/thredds-ocean/dodsC/ncei/archive/data/0129374/daily/livneh_NAmerExt_15Oct2014.195001.nc.html。然后去掉其中的html部分。

我已经使用我的 nctoolkit 包对此进行了测试，它似乎工作正常：

import nctoolkit as nc
ds = nc.open_thredds("https://www.ncei.noaa.gov/thredds-ocean/dodsC/ncei/archive/data/0129374/daily/livneh_NAmerExt_15Oct2014.195001.nc")
ds.select(time = 0)
ds.plot()