如何过滤行为零的基因表达数据集？

【问题标题】：How to filter gene expression data set with rows equal to zeros?如何过滤行为零的基因表达数据集？
【发布时间】：2017-08-05 21:46:51
【问题描述】：

我想删除值完全为零的表达式数据集中的行，我进行了搜索并找到了下面的代码我不确定它是如何工作的，谁能解释我[(3:col(df))]]==0)==col(df)-2, ]这个参数是什么意思？

df[ !(df[rownames(df),[(3:col(df))]]==0)==col(df)-2, ]

【问题讨论】：

标签： r

【解决方案1】：

这是一种笨拙的代码，看起来有点乱码。

df[rowSums(df[,3:ncol(df)]==0)!=ncol(df)-2,]

将选择数据框中最后 (ncol-2) 列不全为零的行。

一个稍微简单的替代方案是

df[any(df[,-(1:2)]!=0),]

【讨论】：

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