Cytoscape - AOP Xplorer 交互

Question

我在这个领域非常陌生。我正在努力成为一名毒理学家，并撰写关于 hERG 抑制和长 QT 综合征的博士论文。我有很多关于文献的数据，并在我的脑海中形成了关于如何将其可视化为 AOP 的数据。然而，说到做到这一点，我的讲师推荐我使用 AOP Xplorer，但我不明白怎么做。

是否可以通过 AOP Xplorer 可视化关于我的主题的我自己的 AOP（我认为可以，但我需要一些文档和培训来理解它）

您能帮我正确理解吗？

我的问候，

Answer 1

看起来您应该能够使用 AOP Xplorer 可视化您自己的 AOP。如果您访问：https://github.com/DataSciBurgoon/aop_networks 他们有许多示例网络（查找 .sif 文件）。如果您以类似方式构建数据，则应该可以将其读入。但是，我从未使用过该应用程序，因此您的里程可能会有所不同...

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