为每个用户设置 R 使用的 libblas 和 liblapack（不是全局/系统范围）Debian Linux 10答案

【问题标题】：Set libblas and liblapack used by R per user (not global/systemwide) Debian Linux 10为每个用户设置 R 使用的 libblas 和 liblapack（不是全局/系统范围）Debian Linux 10
【发布时间】：2021-12-06 16:27:39
【问题描述】：

我可以为我的系统设置默认的 BLAS/LAPACK，然后由 R 使用：

sudo update-alternatives --config libblas.so.3-x86_64-linux-gnu
sudo update-alternatives --config liblapack.so.3-x86_64-linux-gnu

更新用于所有用户的 BLAS/LAPACK。我想在不影响所有其他用户在 R 中使用 BLAS/LAPACK 的情况下选择 BLAS/LAPACK。

我还尝试将我的$LD_LIBRARY_PATH 中的.bashrc 更改为：

LD_LIBRARY_PATH="/usr/lib/x86_64-linux-gnu/openblas:$LD_LIBRARY_PATH"; export LD_LIBRARY_PATH

不更改（即使在注销并再次登录后）R 使用的默认 BLAS/LAPACK（由sessionInfo() 检查）。

为用户使用单独的虚拟机，也许 Docker 也可以，但我希望有一个更简单的解决方案。

【问题讨论】：

标签： r linux user-permissions lapack blas

【解决方案1】：

能够使用以下来源解决此问题： https://www.r-bloggers.com/2020/10/installing-and-switching-to-mkl-on-fedora/ 和 https://www.r-bloggers.com/2020/10/switch-blas-lapack-without-leaving-your-r-session/。

简而言之，我使用了R's flexiblast library，它本身就是flexiblas 的包装器，用于指示每个用户使用哪个BLAS/LAPACK。将系统范围的 BLAS/LAPACK 更改为 flexiblas 后，我在 .Rprofile 中包含以下几行

library(flexiblas)
flexiblas_load_backend('OPENBLASPTHREAD')
# [1] 2
flexiblas_switch(2)

或者当我想加载未安装在 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/ 下的英特尔 MKL BLAS/LAPACK 时，因此无法通过名称（如 OPENBLASPTHREAD）识别：

library(flexiblas)
flexiblas_load_backend("/opt/intel/mkl/lib/intel64/libmkl_rt.so")
# [1] 2
flexiblas_switch(2)

【讨论】：