以编程方式获取基础包列表答案

【问题标题】：Programmatically get list of base packages以编程方式获取基础包列表
【发布时间】：2021-07-04 04:06:07
【问题描述】：

如何让 R 列出其基本安装包。 Dirk 给出了HERE 的列表，但我怎样才能让 R 告诉我这些信息，即 src/library/ 中的包？

getOption("defaultPackages") 很接近，但只列出了其中一些包。

【问题讨论】：

getOption("defaultPackages") 实际上正是我想要的，谢谢！这只是 R 在启动时加载的包。
小心 c(getOption("defaultPackages"), "base") 是 R 在启动时加载的内容。在下面检查我的答案。

标签： r

【解决方案1】：

rownames(installed.packages(priority="base"))
 [1] "base"      "compiler"  "datasets"  "graphics"  "grDevices" "grid"     
 [7] "methods"   "parallel"  "splines"   "stats"     "stats4"    "tcltk"    
[13] "tools"     "utils"

【讨论】：

【解决方案2】：

TL;DR.

rownames(installed.packages(priority = "base")) R.Version() 的所有基础包。
c(getOption("defaultPackages"), "base") 是 R 在启动时加载的内容

installed.packages 将返回您当前安装的软件包。
每个特定 R 版本 (R.Version()) 的基础包总是相同的。这个列表将来可能会随着更新的 R 版本而改变。例如。我记得parallel 的添加时间比其他R `parallel` package does not exist on CRAN? 晚。

getOption("defaultPackages") 是 R 在启动时加载的内容，尽管 base 包不计算在内。
我发现sessionInfo()$basePkgs 解决方案对于启动包更健壮，因为它也包含base 包。然而sessionInfo()$basePkgs 的效率相对较低，因为它是一个简单的遍历所有DESCRIPTION 文件的循环。

microbenchmark::microbenchmark(sessionInfo()$basePkgs,
                               getOption("defaultPackages"))
Unit: nanoseconds
                         expr     min      lq       mean  median      uq      max neval
       sessionInfo()$basePkgs 6172017 6242209 6673759.42 6294546 6848292 16656578   100
 getOption("defaultPackages")     205     246     526.85     451     656     1722   100

【讨论】：

【解决方案3】：

可能有一个更简单的方法，但我认为这应该可以解决问题：

installed.packages()[grep('^base$', installed.packages()[, 'Priority']), ]

【讨论】：

谢谢。为了简单起见，我更喜欢@Josh +1
当然——我没有看 installed.packages 的参数，@Josh 的更清晰。