将 openmp (llvm) 与 sourceCpp 一起使用时找不到 math.h答案

【问题标题】：math.h not found when using openmp (llvm) with sourceCpp将 openmp (llvm) 与 sourceCpp 一起使用时找不到 math.h
【发布时间】：2017-09-28 08:40:09
【问题描述】：

我正在尝试在我的 Rcpp 代码中使用 openmp，但遇到了一些问题（Mac OS）。尝试了很多谷歌搜索，但找不到适合我的解决方案。如果您能提供一些想法，将不胜感激。

我的一些设置： 1) 从 home-brew 安装 llvm 2) ~/.R中的Makevars

CXX= /usr/local/opt/llvm/bin/clang-cpp

CXXFLAGS =-I/usr/local/lib -I/usr/local/opt/llvm/include

LDFLAGS="-L/usr/local/opt/llvm/lib -Wl,-rpath,/usr/local/opt/llvm/lib"

看起来 Makevars 中指定的 LDFLAGS 被忽略了。另外，当我使用 sourceCpp(temp.cpp) 时，我得到了这个错误

usr/local/opt/llvm/bin/clang-cpp -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I/usr/local/include -I/usr/local/include/freetype2 -I/opt/X11/include -I"/Users/myname/库/R/3.2/library/Rcpp/include"-I"/Users/myname/Library/R/3.2/library/RcppArmadillo/include"-fopenmp -fPIC -I/usr/local/lib -I/usr/local /opt/llvm/include -c temp.cpp -o temp.o

在 temp.cpp:2 中包含的文件中： /usr/local/Cellar/llvm/4.0.0_1/bin/../include/c++/v1/math.h:301:15: 致命错误：找不到“math.h”文件

include_next

^~~~~~~~ 产生了 1 个错误。 sourceCpp 中的错误（粘贴（路径 2，“temp.cpp”，sep = “”），详细 = TRUE，：
构建共享库时发生错误 1。 make: *** [temp.o] 错误 1

在temp.cpp中，我放了

#include <math.h>
#include <RcppArmadillo.h>
#include <omp.h>

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]

// [[Rcpp::plugins(openmp)]]



using namespace Rcpp;

【问题讨论】：

确保您阅读了 OS X / macOS 的所有相关常见问题解答条目。根据 Apple 的选择，它仍然不支持 openMP，但如果您安装了正确的工具，您也可以为 R 获得它。这在其他地方都有记录。
@Max Lau 你有没有想过解决方案？

标签： macos llvm openmp rcpp

【解决方案1】：

您是否安装了 Xcode 命令行工具（或在升级操作系统后重新安装）？尝试运行：

xcode-select --install

这是我最近遇到的类似问题的解决方案。

【讨论】：

【解决方案2】：

对于 macos 用户，更新 xcode 并安装它，然后安装 devtools ，它对我有用。

这表明找不到 dplyr 包头。我刚从源头尝试过，一切正常。从犰狳问题单来看，我认为一个问题是没有使用 CRAN 提供的 clang 并设置适当的路径。参考文献安装 clang7 r 二进制文件

https://github.com/rmacoslib/r-macos-clang/issues/10

https://thecoatlessprofessor.com/programming/cpp/r-compiler-tools-for-rcpp-on-macos/

【讨论】：

【解决方案3】：

对于 macOS，最好的解决方案是简单地update 你的 R 版本。最新版本的 R (>3.6) 已解决此问题。

在此处查看讨论 - https://github.com/RcppCore/Rcpp/issues/922

【讨论】：