HDF5 + Eclipse CDT 错误答案

【问题标题】：HDF5 + Eclipse CDT errorsHDF5 + Eclipse CDT 错误
【发布时间】：2018-03-23 13:21:24
【问题描述】：

我正在尝试编辑一个大型风洞模拟以输出 .hdf5 格式而不是当前格式 .CSV 的输出文件。

整个模拟目前在 Eclipse CDT 上运行，并在 Windows 和 Linux 平台上使用 MinGW g++ 编译和链接；我正在使用 Windows 7 企业版设备。我的工作是编辑几行模拟源代码以输出 HDF5 格式的文件。

问题是——如果没有“未定义引用”错误的大杂烩，我无法获得任何链接。我开始使用 Windows 的 HDF5 1.8.19 发行版，但包含的 .lib + .dll 文件是专门为 MSVS2013 编译器设计的。由于 g++ 兼容性，我已经改用 Linux 行尾，但我仍然收到大量“未定义引用”错误。

我正在链接库和包含文件，并且我还在链接它们的搜索路径。问题似乎是由于某种原因 MinGW 链接器无法读取 libhdf5_cpp.a 文件中的符号名称。

有什么想法吗？有没有人有尝试将 Eclipse 与 HDF5 接口的经验？

我只是想运行this 示例代码。

我的输出错误如下：

    g++ "-LC:\\Users\\jk5759\\workspace\\HDF5_Test" -o HDF5_Test.exe main.o -lhdf5_cpp -static 
main.o: In function `main':
C:\Users\jk5759\workspace\HDF5_Test\Debug/../main.cpp:14: undefined reference to `H5check_version'
C:\Users\jk5759\workspace\HDF5_Test\Debug/../main.cpp:14: undefined reference to `H5Fcreate'
C:\Users\jk5759\workspace\HDF5_Test\Debug/../main.cpp:17: undefined reference to `H5Fclose'
collect2: ld returned 1 exit status

【问题讨论】：

标签： c++ windows eclipse gcc hdf5

【解决方案1】：

我将自己回答这个问题，因为网络上根本没有任何资源真正谈论使用 HDF5 + Windows + MinGW GCC + Eclipse。

安装 HDF5 以用于以下操作的说明： -Eclipse CDT 霓虹灯 -Windows 7 企业版 -C++ 编程 -MinGW GCC 编译器

1) 确保您以管理员权限登录。如果没有管理员权限，MinGW 和 MSYS 以及 HDF5 可能无法正确安装。

2) 获取 HDF5 版本 1.8.2。这可通过以下 URL 获得：https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/prev-releases/hdf5-1.8/hdf5-1.8.2/src/ 确保获得 .tar 版本。此文件夹仅包含源代码，未来仍需编辑。

解压缩 tarball 并将其移动到您可以轻松找到的目录中。我的标签为“MyHDFstuff”，位于“Documents”文件夹中。解压缩 tarball 后，找到所有名为 H5pubconf.h 的文件，并将以下行附加到程序末尾：应该有两个H5pubconf.h文件，一个在/src/文件夹，一个在/windows/src/文件夹。

    /* ~~~~ User Added Code ~~~~ */
    #ifndef H5_HAVE_WIN32_API
    #ifdef WIN32 /* defined for all windows systems */
    #define H5_HAVE_WIN32_API 1
    #endif
    #endif

    #ifndef H5_HAVE_MINGW
    #ifdef __MINGW32__ /*defined for all MinGW compilers */
    #define H5_HAVE_MINGW 1
    #endif
    #endif

    //fixes second problem
    #define H5_BUILT_AS_DYNAMIC_LIB 1

3) 获取 Windows 的 MSYS linux 命令行模拟器。这是一个旨在与 MinGW 交互并提供类似 Lunix 的实用程序的工具。我们特别感兴趣的是“./configure”、“make”和“make install”命令。可以在这里获取：http://www.mingw.org/wiki/MSYS

4) 启动 MSYS。使用“cd”命令导航到 MSYS 中的“MyHDFstuff”文件夹。在 MSYS 提示符下运行以下命令：

    $ ./configure --host=x86_64-w64-mingw32 --build=x86_64-w64-mingw32 --disable-hl --prefix=$HOME  
    $ make
    $ make check
    $ make install

这将为 MinGW 编译器构建 HDF5 库。你应该得到一个错误——忽略它，它不会阻止你的代码编译和运行。

5) 在您的 Eclipse 项目设置中，进行以下更改： - 将“hdf5-1.8.2\c++\src”添加到您的包含路径。这是大多数 c++ 实用程序 - 将“hdf5-1.8.2\src”添加到您的包含路径。这是大多数 HDF5 C 根实用程序 -将“hdf5-1.8.2\src.libs”添加到您的库文件夹搜索路径 (-L) -将“hdf5”添加到您的库中（-l）

** 注意，这不会让您完全使用 C++ API 接口，但您可以使用 C 命令 (https://support.hdfgroup.org/HDF5/doc1.8/) 进行编程。如果不遵循这些步骤，那么您将能够使用几个 C 接口命令，包括文件创建，但您的可执行文件将失败，因为它将找不到数据类型接口。

***以后我会附上一个示例C++程序和输出文件以供参考

编码愉快！

【讨论】：

【解决方案2】：

一般来说，由于名称修改问题、异常的不同二进制规范等，C++ 库必须为特定目标编译器显式构建。最好的选择可能是使用 MinGW 从源代码构建 HDF5 库并使用它。

另请参阅here（MinGW 文档）。

【讨论】：