某些程序不接受输入文件的进程替换吗？

Question

我正在尝试对程序的输入文件使用进程替换，但它不起作用。是不是因为某些程序不允许进程替换输入文件？

以下不起作用：

bash -c "cat meaningless_name"
    >sequence1
    gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
    >sequence2
    gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
bash -c "clustalw -align -infile=<(cat meaningless_name) -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Less verbose output, finishing with:
    No sequences in file. No alignment!

但以下控件确实有效：

bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Verbose output, finishing with:
    CLUSTAL-Alignment file created  [output_alignment.aln]
bash -c "cat <(cat meaningless_name) > meaningless_name2"
diff meaningless_name meaningless_name2
    (No output: the two files are the same)
bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name2 -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Verbose output, finishing with:
    CLUSTAL-Alignment file created  [output_alignment.aln]

这表明进程替换本身有效，但 clustalw 程序本身不喜欢进程替换 - 可能是因为它创建了一个非标准文件，或者创建了具有异常文件名的文件。

程序不接受进程替换是否很常见？我将如何检查这是否是问题所在？

我在 Ubuntu 9.10 上运行 GNU bash 版本 4.0.33(1)-release (x86_64-pc-linux-gnu)。 Clustalw 是 2.0.10 版。

Answer 1

进程替换创建一个命名管道。您无法搜索命名管道。

Answer 2

是的。我在其他程序中注意到了同样的事情。例如，它在 emacs 中也不起作用。它给出“文件存在但无法读取”。这绝对是一个特殊的文件，对我来说/proc/self/fd/some_number。在 less 和 most 中，使用默认设置时，它可靠工作。

对于大多数人来说：

most <(/bin/echo 'abcdef')

和更短的不显示任何内容。较长的值会截断开头。 less 显然有效，但前提是您指定 -f。

我发现 zsh 的 = 在实践中更有用。除了 = 而不是 < 之外，它在语法上是相同的。但它只是创建一个临时文件，因此支持不依赖于程序。

编辑：

我发现 zsh 使用TMPPREFIX 来选择临时文件名。所以即使你不希望你真正的/tmp 是tmpfs，你也可以为 zsh 挂载一个。