如何在 R 中使用 AND 来修改数据框答案

【问题标题】：How to use AND in R to modify dataframe如何在 R 中使用 AND 来修改数据框
【发布时间】：2016-07-19 10:27:30
【问题描述】：

我有一个数据矩阵 1200（行，样本名称）* 20000（列，基因名称），当我感兴趣的 5 个基因在所有样本中的值为零时，我想删除行

我用于单基因的命令：

allexp <-preallexp[preallexp$GZMB > 0, ]

但我想在上面的命令中使用 AND，像这样：

allexp <-preallexp[preallexp$GZMB && preallexp$TP53 && preallexp$EGFR && preallexp$BRAF && preallexp$VGEF > 0, ]

但是这个命令不起作用，我需要你的帮助..如何在上面的命令中使用 AND。

【问题讨论】：

&& 只返回条件的第一个逻辑结果，你应该使用&（单和号）你应该每次都重复条件，即preallexp$GZMB > 0 & preallexp$TP53 > 0 & ...
谢谢，digEmAll，但是我想如果5个基因的总和为零，那么删除行，对不起我上面没有提到。

标签： r

【解决方案1】：

编辑：响应 OP。我确信有一种更有效的方式来编写代码，但这就是你所追求的：

allexp <-preallexp[preallexp$GZMB + preallexp$TP53 + preallexp$EGFR + 
                     preallexp$BRAF + preallexp$VGEF > 0, ]

【讨论】：

【解决方案2】：

除非您有负表达式值，否则我会认为 mkt 应该可以工作。但这里是我的。它将删除 5 个基因中的每一个和值为 0 的值行

which(preallexp$GZMB == 0 && preallexp$TP53 && 
 preallexp$EGFR == 0 && preallexp$BRAF == 0 && preallexp$VGEF == 0)

这给出了所有 5 个基因的值都为零的行

所以我们可以从数据框中删除这些行，如下所示

allexp <-preallexp[
   -(which(preallexp$GZMB == 0 && preallexp$TP53 && 
     preallexp$EGFR == 0 && preallexp$BRAF == 0 && preallexp$VGEF == 0)), ]

【讨论】：