如何将我的数据加载到 GraphML 文件中以便在 Prefuse 中使用？答案

【问题标题】：How to load my data into a GraphML file for easy use in Prefuse?如何将我的数据加载到 GraphML 文件中以便在 Prefuse 中使用？
【发布时间】：2010-02-05 20:50:40
【问题描述】：

我正在尝试使用 prefuse 生成一些图形，似乎将数据加载到 prefuse 中的最简单方法是使用 GraphML 文件。

有没有一种简单的方法可以从我的数据中写入这些文件？

或者有没有更简单的方法将我的数据加载到 prefuse 中？

谢谢

【问题讨论】：

取决于您的数据及其格式；)
嗯，我的数据是非常自定义的，所以我需要手动完成。
请您再看看stackoverflow.com/questions/2273068/…的一个前置问题

标签： java xml graph prefuse graphml

【解决方案1】：

yEd 可以导出 GraphML 格式的图形，JGraphT 有一个GraphMLExporter。留下如何将数据放入这些产品或库的问题。但至少两者都可以创建所需的格式。

另一方面 - GraphML 是 XML 格式，因此您可以轻松地使用 jdom 或 dom4j 创建 DOM，根据您的数据添加节点并将其序列化为 XML 文件。这不应该太复杂。

【讨论】：

请您再看看stackoverflow.com/questions/2273068/…的一个前置问题

【解决方案2】：

您可以使用Network Workbench，它允许您以许多不同的形式加载数据，包括边缘列表。边缘列表通常是最容易生成的格式。

我不完全确定您是否可以从 NWB 导出为 GraphML，但 NWB 包含许多可视化，其中一些基于 Prefuse。

如果您想对数据做更多的事情而不是只是将其可视化，那么 NWB 可能会为您提供帮助。

【讨论】：

请您再看看stackoverflow.com/questions/2273068/…的一个前置问题

【解决方案3】：

检查 PyGraphML，这是一个基本的 Python 库，旨在解析和生成 GraphML 文件。 http://hadim.github.io/pygraphml/index.html

【讨论】：