【问题标题】:How can I check whether a python xarray Dataset/DataArray object is loaded into memory, or still points to data on disk?如何检查 python xarray Dataset/DataArray 对象是否已加载到内存中,还是仍指向磁盘上的数据?
【发布时间】:2026-01-22 11:35:02
【问题描述】:

python 中的 xarray 包似乎使用“延迟加载”来指向磁盘上的结构化数据(例如 netCDF、HDF5),然后 loads the data into memory 仅在“必要时”使用。如何检查交互式 Python 会话或 Python 脚本中的给定 Dataset 或 DataArray 对象是否实际“加载”?

理想情况下,像

import xarray as xr
dataset = xr.open_dataset('data.nc') 
dataset.is_loaded() # is it loaded into memory?

不确定这是否是一个有意义的问题,但希望能够安全、自信地控制大型数据集的这种行为,以免不必要地读取整个文件。

【问题讨论】:

  • 我实际上认为目前在 xarray 中使用公共 API 是不可能的。 @shoyer 会有一个明确的答案。

标签: python python-3.x memory ipython python-xarray


【解决方案1】:

目前无法使用公共 API。此信息可通过私有 API 获得。如果您查看带有从磁盘加载的数组的 DataArray.variable._data,如果它正在被缓存,您将看到一个 MemoryCachedArray 对象(从 xarray v0.9 开始):

>>> xarray.DataArray([[1, 2], [3, 4]]).to_netcdf('foo.nc')
>>> array = xarray.open_dataarray('foo.nc')
>>> array.variable._data
MemoryCachedArray(array=CopyOnWriteArray(array=LazilyIndexedArray(array=ScipyArrayWrapper(array=array([[1, 2],
       [3, 4]], dtype=int32)), key=(slice(None, None, None), slice(None, None, None)))))

如果您的数据足够大以至于您担心缓存会出现问题,我绝对建议您使用cache=False 打开任何文件,例如xarray.open_dataarray('foo.nc', cache=False)。在这种情况下,您不会在_data 中看到MemoryCachedArray 对象:

>>> array.variable._data
CopyOnWriteArray(array=LazilyIndexedArray(array=ScipyArrayWrapper(array=array([[1, 2],
       [3, 4]], dtype=int32)), key=(slice(None, None, None), slice(None, None, None))))

如果您仍然认为您需要能够检查是否可以在现有 xarray 对象上进行缓存,请在我们的 GitHub 页面上提出问题以讨论潜在的新 API。

【讨论】:

  • 酷,谢谢!因此,如果我使用cache=False,在我在 Dataset 或 DataArray 切片上调用 .load() 之前,数据是否会被加载(例如,我有一个具有 20 个变量和 1000 个时间步长的 NetCDF,但想从1 个时间步只有 1 个变量)?例如,如果我尝试在使用DataArray 加载 DataArray 后将其乘以 2,该怎么办?该操作是否仍会强制加载到内存中,还是会引发错误?顺便说一句,xarray 很棒而且非常有用。
  • 没错,即使使用cache=False,索引也是惰性的。乘法不是懒惰的,除非你使用 dask。
【解决方案2】:

我认为您可以通过dataset.chunks 检查您的数据集是否被分块。基于此,您可以构造函数检测您的数据集是否已加载,例如:

def is_loaded(chunks):
   out = False
   if chunks is not None:
      out = True
   return out
print(is_loaded(dataset.chunks))

【讨论】:

  • 这行不通。 Xarray 使用延迟加载,无论数据集是否使用 dask 分块。