Lapack 链接错误，使用 -fPIC 重新编译答案

【问题标题】：Lapack linking error, recompile with -fPICLapack 链接错误，使用 -fPIC 重新编译
【发布时间】：2013-09-20 15:28:51
【问题描述】：

我有一个用 Levenberg-Marquardt 方法拟合非线性函数的复杂程序。

该程序使用 Lapack 库中的线性方程系统求解器，我在其中使用过：

extern "C" ...

链接到外部 fortran 库。该程序在我的笔记本电脑上运行没有问题（使用 Ubuntu 12.04），我已经使用它进行了一段时间的测试。

问题：

现在我搬到了大胖的 64 核计算机上，以便开始做一些真正的计算，这台计算机上有一个科学的 linux 6。原来大电脑没有安装lapack，所以我弄了lapack 3.4.2，编译了，然后按照这里的说明编译：

http://matrixprogramming.com/2011/04/using-lapack-from-c/comment-page-1

在那之后，我完全没有改变我之前工作的 cmake 文件，只是添加了链接选项：

-L/xdata/Compilers/Sources/lapack-3.4.2

现在我得到错误：

/usr/bin/ld: /xdata/Compilers/Sources/lapack-3.4.2/liblapack.a(dsytrf.o): relocation R_X86_64_32 against `.rodata' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC

为了记录，我的 cmake 脚本到处都有 -fPIC 和 -fPIE... 我使用它的链接：

target_link_libraries(LibsModule -lgsl)
target_link_libraries(LibsModule -lgslcblas)
target_link_libraries(LibsModule -lrt)
target_link_libraries(LibsModule -lpthread)
target_link_libraries(LibsModule -pie)
target_link_libraries(LibsModule -fPIC)
target_link_libraries(LibsModule -L/xdata/Compilers/Sources/lapack-3.4.2)
target_link_libraries(LibsModule -lgfortran)
target_link_libraries(LibsModule -llapack -fPIC)
target_link_libraries(LibsModule -lblas -fPIC)

我做错了什么？请指教。

谢谢。

【问题讨论】：

标签： c++ linker makefile cmake lapack

【解决方案1】：

解决方案是使用 -fPIC 重新编译 lapack 本身。因此，在您的 make.inc 中更改为以下内容：

FORTRAN  = gfortran -m64 -fPIC
OPTS     = -O2 -m64 -fPIC
DRVOPTS  = $(OPTS)
NOOPT    = -O0 -m64 -fPIC
LOADER   = gfortran -m64 -fPIC

您还可以使用-O3 进行更好的优化，效果很好！

-m64 选项取决于您是否要使用 64 位系统。你的选择！

干杯！

【讨论】：

【解决方案2】：

如果使用mkdir build; cd build; cmake ..; make 路由，请使用cmake .. -DBUILD_SHARED_LIBS=ON。

为什么会这样？ -fPIC 选项使 gcc 使用相对地址 [1]
评论接受的答案： “更具体地说，共享库应该在进程之间共享，但可能并不总是可以在两者的相同地址加载库。如果代码不是位置独立的，那么每个进程都需要自己的复制”——西蒙·里希特
[1]GCC -fPIC option

【讨论】：