通过网络提取 gzip 文件 [重复]答案

【问题标题】：Extracting gzip files over the network [duplicate]通过网络提取 gzip 文件 [重复]
【发布时间】：2013-04-17 09:50:09
【问题描述】：

我在 Windows 7 上使用 R.2.15.2，我无法解压缩存储在网络上的 .gz 文件。我也在使用gnuwin32（如果有帮助的话）

看到文件了，所以位置没问题

system("ls")
file1.bla.gz
file2.bla.gz
file3.bla.gz
...

R) unzip("./file1.bla.gz")
Message d'avis :
In unzip("./file1.bla.gz") :
erreur 1 lors de l'extraction d'un fichier zip

R) untar("./file1.bla.gz")
/usr/bin/tar: This does not look like a tar archive
/usr/bin/tar: Skipping to next header

使用函数unzip 也不行，看起来它只处理.zip 文件。不确定问题出在网络上还是我错误地调用它...

如何提取此文件？

编辑：以下有效

system(" \"C:\\Program Files\\7-Zip\\7z.exe\" e -y file1.bla.gz")

感谢@Paul Hiemstra，来自R.utils 的gunzip 更好

【问题讨论】：

定义“不工作”。该特定文件/文件夹的读/写选项是什么？
您是否尝试过使用gzfile？
@RomanLuštrik: 不工作 == 我找不到在 R James 中解压缩文件的方法：我刚试过，gzfile("the gz file name") 没有成功
没有成功？！我们如何才能在没有错误消息和代码的情况下提供帮助？请张贴这些
我会避免直接调用7zip，这会降低代码的可移植性。请参阅我使用gzfile 打开 gzip 压缩文件的更新答案。

标签： windows r unzip gunzip

【解决方案1】：

您可以使用gzfile 访问gzip 压缩文件的内容，例如：

read.table(gzfile("/tmp/foo.csv.gz"))

foo.csv.gz 是一个 gzip 压缩的 csv 文件。我在this post 中得到了@DirkEddelbuettel 的答案。

如果您的目标是提取文件，您可以使用R.utils 包中的gunzip 函数。请参阅thisR-help 帖子。

【讨论】：

好吧，我认为它有效，但不是，所以这是.tar档案而不是.gz
tar 还支持提取gzip 档案，因为它们经常串联使用。 tar 创建包含所有文件的单个文件，gzip 添加压缩。
stackoverflow.com/questions/5764499/decompress-gz-file-using-r 说它应该可以工作。
我不这么认为，如果tar.gz 不是我的情况，您所指的链接需要untar。我进行了编辑以向您显示失败消息
您可以使用gzfile 访问gzip 压缩文件，请参阅我的更新答案。