连接许多相似的文件答案

【问题标题】：Concatenating many similar files连接许多相似的文件
【发布时间】：2014-08-02 09:55:26
【问题描述】：

如果我有一堆文件标记如下：

fasta_Watson_0
fasta_Watson_1
fasta_Watson_2
...
fasta_Watson_190

如何编写一个 awk 脚本来自动将所有文件连接成一个文件？

手写输入：

cat fasta_Watson_0 fasta_Watson_1 ...

实在是太乏味了！

【问题讨论】：

标签： unix cat

【解决方案1】：

您可以使用bash wildcards，但您必须担心排序顺序。可能会做类似this post 上建议的事情。

cat `ls fasta_Watson_* |sort -n -t "_" -k 3`

【讨论】：

仅当全局排序顺序为他提供他想要的文件顺序时才为真。这可能是也可能不是。他的示例中给出的文件绝对不是这种情况，因为它们将排序0, 1, 10, 11, ..., 2, 20, ..., 3, etc。
为什么要将ls 加入其中，而不仅仅是echo？还有为什么 subshell 和 cat?
虽然这里确实没有必要，但 Linux 上的 ls -v (GNU ls) 会按所需顺序列出文件。该解决方案不是可移植的； ls -v 在 Mac OS X 上有不同的含义（根据 POSIX，没有指定含义）。

【解决方案2】：

到cat他们都按数字顺序并将结果保存在一个名为output的文件中，使用：

cat fasta_Watson_{0..190} >output

{0..190} 构造是一个代表从 0 到 190 的所有数字的 bashism。如果您的 shell 不支持，您可以使用标准实用程序 seq：

cat $(seq -f 'fasta_Watson_%g' 0 190) > output

【讨论】：

或使用cat $(seq -f 'fasta_Watson_%g' 0 190) > output，它使用seq 的-f 选项来显式生成名称，而无需shell 循环（节省cat 的执行次数）。这个答案（和我的变体）取决于文件的数量是否足够小，以至于列表不会超出对命令的参数列表长度的限制。
@JonathanLeffler 很好的建议。谢谢。