使用文件 *.dat 从父文件夹运行 qsub 命令到下面的所有目录答案

【问题标题】：Run a qsub command from a parent folder to all directories below with a file *.dat使用文件 *.dat 从父文件夹运行 qsub 命令到下面的所有目录
【发布时间】：2013-06-05 14:48:59
【问题描述】：

我正在使用 Redhat 和 pbs 排队系统将作业提交给有限元分析代码。我通常有一个文件夹，其中包含一个 .dat 文件，这是我要运行的文件，以及一个将提交 .dat 文件的 .pbs 文件。要提交 .dat 文件，我将在包含这两个文件的目录中运行命令“qsub *.pbs”。

我如何从包含 .dat 文件的目录之外提交或只运行“qsub *.pbs”。我通常是 .dat 文件的两个目录。

谢谢

【问题讨论】：

标签： command-line qsub

【解决方案1】：

你可以做一个查找和执行

find /tmp/foo -name "*.pbs" -exec qsub {} \;

这是我运行的一个测试

[spuder@moab tmp]$ mkdir /tmp/torqueFun
[spuder@moab tmp]$ cd !$
[spuder@moab torqueFun]$ touch foo.pbs
[spuder@moab torqueFun]$ touch bar.pbs
[spuder@moab torqueFun]$ touch foobar.pbs

[spuder@moab torqueFun]$ find . -name "*.pbs" -exec qsub {} \;
19185.moab.novalocal
19186.moab.novalocal
19187.moab.novalocal

【讨论】：

我如何实际运行 pbs 文件在它们各自的目录中，而不是在执行此命令的目录中？
命令find . 将搜索当前目录。您可以像这样搜索任何文件夹：find /some/directory.
我认为你误解了我的问题。如果我说转到父文件夹并执行您编写的命令。然后，就像我想要的那样，它进入每个子目录并执行每个 PBS 文件。但是，pbs 文件在父目录而不是子目录中执行。我所有的子目录都有不同的名称。我不确定如何通过编辑您发送的命令或编辑我的 pbs 文件来解决此问题。注意我有 20 个子目录，每个子目录都有不同的 pbs 文件。
我说的有道理吗？假设我在名为“A”的父目录中，并且我有子目录，“1t”到“20t”当我在父目录“A”并执行命令时，它实际上尝试从每个子目录运行 pbs 文件，但运行它们在没有输入脚本的父目录中，这导致了很多错误文件。
您可以尝试 cd-ing 进入它找到 .pbs 文件的每个目录，然后 cd-ing 退出。或者您可以尝试覆盖 PWD 环境变量。如果这没有帮助，那么您可能应该打开一个新的堆栈溢出问题。