【发布时间】:2012-06-15 05:34:38
【问题描述】:
我在使用 R 时遇到了一个问题,我似乎无法弄清楚如何解决。
尝试从源代码安装 R 包时,我遇到了以下错误:
* installing *source* package ‘cthresh’ ... ** libs *** arch - i386 sh: make: command not found ERROR: compilation failed for package ‘cthresh’ * removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/cthresh’
这会让你认为我没有安装编译器或者没有设置 $PATH。两者都不是真的。我已经安装了 XCode 并且 echo $PATH 给了我:
echo $PATH
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/Current/bin:/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/Current/bin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin:/usr/local/bin:/usr/X11/bin:/Users/admn/bin:/usr/local/bin:/Users/admn/bin:/usr/local/bin:/Users/admn/bin:/usr/local/bin:/Developer-3.2.5/usr/bin:/Users/admn/bin:/usr/local/bin:/Developer-3.2.5/usr/bin
所以你可以看到 Developer 出现在 /usr/bin 中
我什至通过以下方式确定了:
导出 PATH=${PATH}:/Developer-3.2.5/usr/bin
如果我在 bash 或 sh 中调用“make”:
sh-3.2$ make make: * 没有指定目标,也没有找到 makefile。 停下来。
bash-3.2$ make make: * 没有指定目标,也没有找到 makefile。 停下来。
编译器在那里:
bash-3.2$ gcc i686-apple-darwin10-gcc-4.2.1:没有输入文件
bash-3.2$ g++ i686-apple-darwin10-g++-4.2.1:没有输入文件
那是什么?为什么 R 不能“制造”?我真的对此一无所知,似乎无法在任何地方找到答案!我的猜测是 R 不是在寻找正确的编译器或其他东西,但我不知道如何检查它在哪里寻找以及为什么它在“make”上失败
我使用的是 OSX Lion 的 MacBook Pro。请帮忙!
---编辑----
好的,我在这个问题上取得了一些进展。虽然我加了
PATH=${PATH}:/Developer-3.2.5/usr/bin
到我的 bash/sh .profile 中,我还需要将它添加到 .Renviron 文件中。我在以下位置找到该文件:/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/etc/
但现在我收到了这个错误:
- 正在安装源代码包'cthresh' ... ** 库 * 拱门 - i386 make: * 没有规则来制作目标
._cthreb.o', needed bycthresh.so'。停止。 错误:包“cthresh”编译失败
这让我觉得这个 .Renviron 文件中可能还有其他内容要添加?关于什么的任何想法?
【问题讨论】:
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好的,我在这个问题上取得了一些进展。即使我已将 PATH=${PATH}:/Developer-3.2.5/usr/bin 添加到我的 bash/sh .profile 中,我仍需要将其添加到 .Renviron 文件中。我在以下位置找到该文件:/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/etc/
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R 的 mac faq 可能有一些不错的提示,尤其是第 2 节。cran.r-project.org/bin/macosx/RMacOSX-FAQ.html
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将此发布到 r-sig-mac 邮件列表。他们将向您指出有关设置 Lion 以编译 R 包的常见问题解答。