【发布时间】:2019-09-03 18:44:41
【问题描述】:
我正在尝试使用 getopts 将命令行参数传递给我的工作流脚本,但代码会引发错误
下面是传递命令行参数的sn-p代码
# take strings as arguments.
while getopts "TDNUW:" opt; do
case "$opt" in
T) T="$OPTARG" ;;
D) D="$OPTARG" ;;
N) N="$OPTARG" ;;
U) U="$OPTARG" ;;
W) W="$OPTARG" ;;
\?) echo "Usage:[-T T1wfilename] [-D Dfilename] [-N Stream_Number] [-U User] [-W Workflow]";;
esac
done
shift $(expr $OPTIND - 1)
#Subjects Directory with $U : UserId
SUBJECTS_DIR=/Bio/Bmax/data/imaging_data/$U
#Subjects path with $W : workflow number
SUBJECT_PATH=$SUBJECTS_DIR/$W
我尝试使用选项调用脚本
./code.sh -T dummy_t1t2.nii.gz -D dummy_dti.nii.gz -N 100000 -U Markus -W Workflow_000000000000334
我遇到了一个错误
Error: input image /Bio/Bmax/data/imaging_data/// not valid
我通过命令行传递的参数没有被代码解释,有人可以给我一些提示,为什么我的脚本无法识别这些参数。
【问题讨论】:
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你没有给变量 U 和 W 赋值,你期待什么?
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我正在为参数-U和-W分配-U Markus -W Workflow_000000000000334两个值,是不是分配变量的方法不对?
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":TDNUW"- 您指定的选项都没有任何参数。getopts需要知道哪些选项需要参数,哪些不需要 -
但是
optarg现在不关心这个了。来自man optarg :If a character is followed by a <colon>, the option shall be expected to have an argument如果不是,那就不是。 -
@KamilCuk,所以我应该在选项后使用冒号吗?